More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2446 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 304 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  53.56 
 
 		 304 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  54.33 
 
 		 305 aa  301  7.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  57.35 
 
 		 295 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  56.27 
 
 		 295 aa  295  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  51.57 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  51.6 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  52.56 
 
 		 293 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  51.96 
 
 		 302 aa  285  5.999999999999999e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  51.96 
 
 		 302 aa  285  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  53.22 
 
 		 304 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  53.61 
 
 		 306 aa  281  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  53.76 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  53.41 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  51.22 
 
 		 296 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  50.54 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  46.5 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  54.48 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  51.39 
 
 		 295 aa  257  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  43.94 
 
 		 302 aa  256  4e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  47.77 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  50.87 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  49.83 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  46.92 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  51.22 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  45.3 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  39.86 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  41.76 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 		 313 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  42.49 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  43.96 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  40.91 
 
 		 308 aa  208  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  41.39 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  42.01 
 
 		 312 aa  205  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  42.03 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  41.13 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  40.48 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  38.31 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  43.77 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  42.55 
 
 		 315 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  36.2 
 
 		 311 aa  192  7e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  39.04 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  36.84 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  40 
 
 		 296 aa  186  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 		 328 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  41.3 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 		 319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 		 319 aa  182  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  40.42 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  38.33 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  38.83 
 
 		 304 aa  178  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  35.56 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  37.23 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  38.57 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  34.59 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  34.14 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  32.37 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  32.86 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  36.19 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  32.85 
 
 		 326 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 		 307 aa  148  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  29.28 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  31.2 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  30.29 
 
 		 325 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  29.2 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  30.26 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  32.31 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  28.83 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  28.83 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  28.83 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  29.45 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  28.83 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  31.44 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 312 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  28.47 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  29.96 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  29.96 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  29.59 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  29.09 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  29.09 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  29.09 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  29.09 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  29.09 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  29.09 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  29.09 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>