More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0846 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 459 aa  927    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  73.36 
 
 		 460 aa  692    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  68.93 
 
 		 459 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 		 474 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 		 483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 		 478 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  34.81 
 
 		 460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  36.11 
 
 		 460 aa  289  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 479 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 		 460 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  35.17 
 
 		 481 aa  280  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  35.01 
 
 		 459 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  36.48 
 
 		 476 aa  271  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  34.02 
 
 		 462 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  34.22 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 		 483 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  33.95 
 
 		 460 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  29.74 
 
 		 466 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  31.39 
 
 		 488 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  40.07 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 311 aa  190  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  38.73 
 
 		 311 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  36.97 
 
 		 307 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  35.52 
 
 		 328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  36.4 
 
 		 327 aa  163  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  32.38 
 
 		 308 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 285 aa  156  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  36.57 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  26.1 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  25.28 
 
 		 450 aa  153  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  31.25 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  35.31 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  27.96 
 
 		 318 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  32.66 
 
 		 310 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  31.49 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  29.05 
 
 		 312 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  28.21 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  26.62 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  29.06 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  27.87 
 
 		 292 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  31.08 
 
 		 317 aa  134  5e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  33.67 
 
 		 300 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  29.2 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  31.08 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  27.47 
 
 		 302 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 		 305 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  28.81 
 
 		 325 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  28.28 
 
 		 325 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  31.08 
 
 		 289 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  29.5 
 
 		 296 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  27.81 
 
 		 300 aa  128  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  27.9 
 
 		 293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.54 
 
 		 302 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  27.68 
 
 		 289 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  27.11 
 
 		 298 aa  127  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  28.52 
 
 		 300 aa  126  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  27.37 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  26.37 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  26.62 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 		 290 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  27.6 
 
 		 310 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  27.01 
 
 		 289 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  27.01 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1554  cation diffusion facilitator family transporter  32.66 
 
 		 301 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  31.53 
 
 		 302 aa  124  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  27.37 
 
 		 298 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  27.15 
 
 		 300 aa  124  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  27.01 
 
 		 296 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  27.01 
 
 		 296 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1891  cation diffusion facilitator family transporter  28.95 
 
 		 314 aa  123  7e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0381749 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  28.15 
 
 		 305 aa  123  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  31.37 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  28.93 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  28.12 
 
 		 313 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  26.82 
 
 		 291 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  27.3 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  26.32 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  29.26 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  26.6 
 
 		 295 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  26.6 
 
 		 295 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  28.1 
 
 		 299 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  27.92 
 
 		 290 aa  120  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  25.94 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  28.04 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  27.46 
 
 		 293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  26.64 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  30.55 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  26.98 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>