More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1360 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
396 aa  786    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1417  cation diffusion facilitator family transporter  36.07 
 
 
384 aa  244  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1276  cation diffusion facilitator family transporter  41.64 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2257  cation diffusion facilitator family transporter  40.77 
 
 
416 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0567  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 
402 aa  195  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.714766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3458  cation diffusion facilitator family transporter  34.67 
 
 
413 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1224  cation diffusion facilitator family transporter  32.61 
 
 
421 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  31.34 
 
 
410 aa  159  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  29.94 
 
 
381 aa  155  9e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1496  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 
400 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1214  cation diffusion facilitator family transporter  27.94 
 
 
406 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0101557  hitchhiker  0.000000113777 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  34.11 
 
 
311 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  33.55 
 
 
311 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  31.51 
 
 
307 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  32.78 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  31.82 
 
 
291 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 
306 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 
306 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  31.36 
 
 
291 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 
323 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  31.5 
 
 
291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  30.04 
 
 
307 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  28.16 
 
 
301 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  29.6 
 
 
310 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 
460 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  31.87 
 
 
289 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 
315 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 
295 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 
304 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  29.9 
 
 
295 aa  123  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  27.93 
 
 
422 aa  122  8e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  32.23 
 
 
289 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  30.11 
 
 
300 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  28.28 
 
 
411 aa  122  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  29.76 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  28.04 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 
295 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  29.5 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  26.71 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  28.3 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 
288 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.82 
 
 
303 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 
288 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  29.09 
 
 
299 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 
466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  30.41 
 
 
310 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  27.84 
 
 
296 aa  119  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  29.14 
 
 
305 aa  119  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 
285 aa  119  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  29.71 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  29.62 
 
 
481 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  29.07 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.71 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  27.82 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  31.79 
 
 
285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  29.32 
 
 
476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 
307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 
306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 
304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  30.94 
 
 
307 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 
293 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  30.17 
 
 
296 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  27.18 
 
 
337 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 
293 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  28.89 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 
292 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  27.65 
 
 
295 aa  117  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  26.8 
 
 
388 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  28.99 
 
 
302 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  31.38 
 
 
293 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  28.82 
 
 
319 aa  116  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  28.36 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  29.07 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  26.96 
 
 
295 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  29.57 
 
 
298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 
295 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  26.96 
 
 
295 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  28.57 
 
 
302 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  31.62 
 
 
299 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 
318 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  28.57 
 
 
302 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 
459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  27.59 
 
 
297 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  26.74 
 
 
299 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 
293 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  27.92 
 
 
308 aa  113  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
308 aa  113  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  28.03 
 
 
305 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 
384 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  27.37 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  30.43 
 
 
294 aa  112  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  29.54 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  31.88 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  31.52 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  27.94 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  24.32 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>