More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1496 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1214  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 406 aa  798    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0101557  hitchhiker  0.000000113777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1496  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 400 aa  796    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3458  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2257  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1276  cation diffusion facilitator family transporter  29.3 
 
 		 416 aa  154  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1417  cation diffusion facilitator family transporter  32.21 
 
 		 384 aa  152  8.999999999999999e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1224  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  27.3 
 
 		 381 aa  145  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0567  cation diffusion facilitator family transporter  29.69 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.714766  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  25.27 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 		 395 aa  103  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  28.76 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  24.1 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  28.71 
 
 		 317 aa  92.8  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  27.5 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0839  Co/Zn/Cd cation transporter  26.58 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000456084  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  25.82 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  27.27 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  27.68 
 
 		 301 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 		 337 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  25.71 
 
 		 303 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  24.23 
 
 		 354 aa  86.7  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  28.03 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  22.99 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  24.75 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  23.49 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  24.74 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  26.22 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  26.33 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  26.95 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  26.57 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  24.83 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  28.06 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  28.06 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  27.37 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  27.68 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4263  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.961398  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  28.95 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  24.03 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  24.03 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  24.75 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  28.17 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  26.83 
 
 		 307 aa  79.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  28.17 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  27.7 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  28.57 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  22.67 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  26.22 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  28.38 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  27.97 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  27.7 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  26.42 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  25.44 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  26.17 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  27.92 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  26.17 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  28.16 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  28.82 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  22.26 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  28.38 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  28.38 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  27.15 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  26.33 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  22.26 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  27.17 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  27.36 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1961  cation diffusion facilitator family transporter  31.09 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  24.56 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0941  cation efflux protein  28.62 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0344  cation transporter  23.44 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  27.06 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  23.83 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  23.83 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  21.89 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  25.27 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  25.45 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3726  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  24.48 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  29.24 
 
 		 310 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12062  hypothetical protein  29.25 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  24.56 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  24.28 
 
 		 297 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 297 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2352  cation diffusion facilitator family transporter  27.6 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.549755  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  23.91 
 
 		 299 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  27.43 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  24.56 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  25.55 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>