More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1832 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  100 
 
 
410 aa  819    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  52.55 
 
 
411 aa  442  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0839  Co/Zn/Cd cation transporter  29.68 
 
 
428 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000456084  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  32.03 
 
 
381 aa  194  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0567  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 
402 aa  194  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.714766  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2257  cation diffusion facilitator family transporter  31.51 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1276  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 
416 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1961  cation diffusion facilitator family transporter  31.2 
 
 
437 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 
396 aa  159  7e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1224  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 
421 aa  157  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3458  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  29.9 
 
 
291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 
291 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 
293 aa  126  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  29.3 
 
 
300 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  26.8 
 
 
290 aa  123  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  29.9 
 
 
291 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 
310 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  28.68 
 
 
297 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  27.94 
 
 
297 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  27.57 
 
 
297 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1214  cation diffusion facilitator family transporter  25.27 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0101557  hitchhiker  0.000000113777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1496  cation diffusion facilitator family transporter  25.27 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  27.57 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  29.11 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  27.94 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  29.11 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  27.57 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.57 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  28.77 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.57 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  27.57 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  27.57 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  29.2 
 
 
296 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  29.2 
 
 
296 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  28.83 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  28.47 
 
 
293 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  28.21 
 
 
289 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  28.1 
 
 
293 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  27.21 
 
 
298 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  26.85 
 
 
305 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  28.1 
 
 
293 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 
460 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 
315 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  27.84 
 
 
289 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  28.1 
 
 
293 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  26.16 
 
 
317 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  26.71 
 
 
293 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 
337 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  26.06 
 
 
323 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  24.6 
 
 
401 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25 
 
 
378 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
378 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  27.41 
 
 
395 aa  103  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  31.19 
 
 
319 aa  103  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  30.04 
 
 
313 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1417  cation diffusion facilitator family transporter  26.43 
 
 
384 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  26.71 
 
 
307 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  25.42 
 
 
340 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  27.3 
 
 
296 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  26.47 
 
 
380 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 
340 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 
460 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.31 
 
 
306 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  28.3 
 
 
306 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  26.88 
 
 
380 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 
382 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  28.26 
 
 
323 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 
314 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12062  hypothetical protein  22.95 
 
 
332 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  27.88 
 
 
354 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  25.94 
 
 
299 aa  99.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
298 aa  99.8  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  30.43 
 
 
462 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  26.55 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  26.74 
 
 
299 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 
459 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  27.73 
 
 
291 aa  98.6  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  29.07 
 
 
302 aa  96.7  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 
306 aa  96.7  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  29.57 
 
 
302 aa  96.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  29.07 
 
 
302 aa  96.7  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
298 aa  96.7  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  26.92 
 
 
476 aa  96.3  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  28.03 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  29.57 
 
 
303 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  28.8 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  26.79 
 
 
320 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 
478 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 
400 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  25.93 
 
 
294 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  25.85 
 
 
460 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3726  cation diffusion facilitator family transporter  25.26 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  27.66 
 
 
460 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  25.52 
 
 
289 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  26.1 
 
 
459 aa  94.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  26.52 
 
 
385 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  26.25 
 
 
389 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>