More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12062 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12062  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  651    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  76.03 
 
 
340 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  76.03 
 
 
340 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  76.03 
 
 
314 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3726  cation diffusion facilitator family transporter  78.23 
 
 
381 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1902  cation diffusion facilitator family transporter  77.33 
 
 
342 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3225  cation diffusion facilitator family transporter  77.14 
 
 
356 aa  461  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4263  cation diffusion facilitator family transporter  55.59 
 
 
445 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.961398  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1898  cation diffusion facilitator family transporter  56.55 
 
 
371 aa  325  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338439  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2352  cation diffusion facilitator family transporter  56.96 
 
 
357 aa  325  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.549755  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5042  cation diffusion facilitator family transporter  56.52 
 
 
375 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1220  cation efflux family protein  50.79 
 
 
376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2355  cation diffusion facilitator family transporter  55.39 
 
 
355 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00021391  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  49.66 
 
 
380 aa  289  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3649  cation efflux system protein  46.88 
 
 
384 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.29953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0284  cation diffusion facilitator family transporter  47.65 
 
 
341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2329  cation diffusion facilitator family transporter  54.33 
 
 
343 aa  277  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0596  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 
422 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  29.18 
 
 
354 aa  132  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  26.04 
 
 
290 aa  129  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  33.96 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  32.75 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  25.78 
 
 
291 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  32.08 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  26.74 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  26.22 
 
 
291 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  26.57 
 
 
411 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  25.51 
 
 
293 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 
299 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  31.79 
 
 
303 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  27.13 
 
 
319 aa  105  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  28.57 
 
 
389 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  30.45 
 
 
385 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 
322 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  24.41 
 
 
381 aa  103  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  22.95 
 
 
410 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 
307 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 
385 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 
385 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  26.22 
 
 
299 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  27.71 
 
 
401 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 
337 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  27.13 
 
 
306 aa  99.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  25.54 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
318 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  29.76 
 
 
384 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  29.76 
 
 
385 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  31.67 
 
 
308 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  32.12 
 
 
400 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  28.37 
 
 
309 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  28.08 
 
 
293 aa  95.9  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  31.9 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  25.67 
 
 
331 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  30.37 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 
418 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  25.78 
 
 
289 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  27.21 
 
 
317 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  28.44 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  28.44 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  23.27 
 
 
313 aa  94.4  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  28.98 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  25.44 
 
 
299 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  27.72 
 
 
411 aa  92.8  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  25.95 
 
 
293 aa  92.4  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 
285 aa  92.4  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  25.18 
 
 
289 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 
307 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  24.82 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  26.88 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  26.43 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  24.82 
 
 
289 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1276  cation diffusion facilitator family transporter  28.73 
 
 
416 aa  90.9  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  27.06 
 
 
423 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  29.57 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 
300 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  25.76 
 
 
296 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  30.43 
 
 
307 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  24.42 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  27.84 
 
 
296 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  26.1 
 
 
313 aa  89.4  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  27.72 
 
 
298 aa  89.4  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  25.42 
 
 
296 aa  89  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  25.51 
 
 
293 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  25.42 
 
 
296 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 
285 aa  89  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.73 
 
 
378 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 
312 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  25.42 
 
 
296 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  25.71 
 
 
293 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  27.51 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  24.73 
 
 
378 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  28.57 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  25.36 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  25.1 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  25.1 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>