More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2352 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2352  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
357 aa  671    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.549755  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  57.7 
 
 
340 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  57.7 
 
 
340 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  57.7 
 
 
314 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12062  hypothetical protein  55.94 
 
 
332 aa  339  5e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3726  cation diffusion facilitator family transporter  57.56 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1898  cation diffusion facilitator family transporter  62.16 
 
 
371 aa  329  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338439  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1902  cation diffusion facilitator family transporter  58.69 
 
 
342 aa  322  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3225  cation diffusion facilitator family transporter  57.05 
 
 
356 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5042  cation diffusion facilitator family transporter  56.73 
 
 
375 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1220  cation efflux family protein  50.63 
 
 
376 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  50.98 
 
 
380 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3649  cation efflux system protein  44.93 
 
 
384 aa  298  9e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.29953 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4263  cation diffusion facilitator family transporter  51.2 
 
 
445 aa  291  8e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.961398  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2355  cation diffusion facilitator family transporter  61.51 
 
 
355 aa  289  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00021391  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2329  cation diffusion facilitator family transporter  48.85 
 
 
343 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0284  cation diffusion facilitator family transporter  44.9 
 
 
341 aa  256  5e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0596  cation diffusion facilitator family transporter  50.68 
 
 
296 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  25.35 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  28.41 
 
 
354 aa  116  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  34.63 
 
 
305 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  28.16 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 
320 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  26.71 
 
 
292 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  28.57 
 
 
380 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  28.57 
 
 
380 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  24.9 
 
 
291 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  29.18 
 
 
411 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  24.9 
 
 
291 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  29.82 
 
 
318 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  29.87 
 
 
311 aa  103  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 
317 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  23.86 
 
 
312 aa  100  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  29.17 
 
 
322 aa  99.8  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  23.41 
 
 
290 aa  99  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  29.22 
 
 
311 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  26.88 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  30.16 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  23.81 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  26.37 
 
 
299 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  28.34 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  27.36 
 
 
310 aa  96.7  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  30.45 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  24.51 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.75 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  25.75 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  29.02 
 
 
385 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  26.74 
 
 
301 aa  94  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  26.37 
 
 
299 aa  93.2  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  28.08 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  29.01 
 
 
309 aa  92.8  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 
404 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.98 
 
 
306 aa  92.4  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  26.85 
 
 
296 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  25 
 
 
331 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 
382 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  26.09 
 
 
299 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.98 
 
 
306 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  27.41 
 
 
306 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  25.68 
 
 
299 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  26.38 
 
 
401 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  29.9 
 
 
382 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  29.55 
 
 
307 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 
308 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  29.55 
 
 
307 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  37.02 
 
 
332 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 
337 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  31.32 
 
 
378 aa  89.7  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  22.77 
 
 
297 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  22.44 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  28.24 
 
 
388 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  22.77 
 
 
297 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  22.44 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  22.44 
 
 
297 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  22.44 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  22.44 
 
 
297 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  22.44 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  22.92 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  24.51 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 
312 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  27.88 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  22.44 
 
 
298 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  28.2 
 
 
303 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  28.32 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  22.77 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  28.07 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  30.54 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  27.81 
 
 
389 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 
460 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  37.02 
 
 
314 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  25.67 
 
 
289 aa  87  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  24.02 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 
305 aa  86.7  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  29.43 
 
 
307 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>