More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1898 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1898  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 371 aa  709    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5042  cation diffusion facilitator family transporter  82.67 
 
 		 375 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12062  hypothetical protein  56.21 
 
 		 332 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  55.52 
 
 		 340 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  55.52 
 
 		 340 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  57.05 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2352  cation diffusion facilitator family transporter  62.16 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.549755  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1902  cation diffusion facilitator family transporter  56.01 
 
 		 342 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3726  cation diffusion facilitator family transporter  57.09 
 
 		 381 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3225  cation diffusion facilitator family transporter  58.12 
 
 		 356 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2355  cation diffusion facilitator family transporter  60.06 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00021391  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3649  cation efflux system protein  44.88 
 
 		 384 aa  272  7e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.29953 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  45.95 
 
 		 380 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1220  cation efflux family protein  47.57 
 
 		 376 aa  265  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4263  cation diffusion facilitator family transporter  49.27 
 
 		 445 aa  265  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.961398  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2329  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 		 343 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0284  cation diffusion facilitator family transporter  42.94 
 
 		 341 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0596  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 		 422 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  28.07 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  31.34 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  28.36 
 
 		 411 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  30.39 
 
 		 337 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  29.5 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  25.3 
 
 		 291 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 307 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 307 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  26.92 
 
 		 306 aa  103  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  28.98 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  27.82 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 		 317 aa  99.4  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  30.94 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  28.52 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 318 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  25.44 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  27.18 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  29.47 
 
 		 293 aa  97.4  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 		 308 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  26.56 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  24.16 
 
 		 297 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  29.84 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  32.32 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 307 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 		 404 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  32.27 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  23.83 
 
 		 297 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 		 404 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 330 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 		 346 aa  93.6  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  24.13 
 
 		 291 aa  93.6  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  29.01 
 
 		 382 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  23.49 
 
 		 297 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  32.3 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  23.49 
 
 		 297 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  23.49 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  23.49 
 
 		 297 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  23.49 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  23.49 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  26.83 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  23.49 
 
 		 297 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  30.49 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  30.49 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  34.1 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  30.13 
 
 		 418 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  27.06 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  33.83 
 
 		 300 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  25.68 
 
 		 289 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  25.49 
 
 		 401 aa  90.1  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 		 290 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  29.84 
 
 		 385 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  22.59 
 
 		 297 aa  90.1  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  28.96 
 
 		 318 aa  89.7  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  33.33 
 
 		 297 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  22.68 
 
 		 312 aa  89.7  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  25.1 
 
 		 289 aa  89.4  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 		 301 aa  89.4  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  20.31 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  30.87 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  28.7 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  30.16 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  25.18 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  27.56 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  21.03 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  23.15 
 
 		 298 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  29.46 
 
 		 320 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  26.06 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  26.21 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  25.3 
 
 		 299 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  24.9 
 
 		 299 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  26.88 
 
 		 299 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  23.85 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  25.85 
 
 		 460 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  28.63 
 
 		 314 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24.1 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>