More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2329 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2329  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
343 aa  683    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1220  cation efflux family protein  62.54 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3649  cation efflux system protein  59.61 
 
 
384 aa  393  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.29953 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  57.84 
 
 
380 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12062  hypothetical protein  54.33 
 
 
332 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2352  cation diffusion facilitator family transporter  49.2 
 
 
357 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.549755  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  50.5 
 
 
314 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  50.5 
 
 
340 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  50.5 
 
 
340 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3726  cation diffusion facilitator family transporter  49.68 
 
 
381 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5042  cation diffusion facilitator family transporter  51.01 
 
 
375 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1902  cation diffusion facilitator family transporter  51.2 
 
 
342 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0284  cation diffusion facilitator family transporter  46.22 
 
 
341 aa  276  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1898  cation diffusion facilitator family transporter  49.83 
 
 
371 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338439  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4263  cation diffusion facilitator family transporter  44.35 
 
 
445 aa  262  8e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.961398  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3225  cation diffusion facilitator family transporter  49.16 
 
 
356 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2355  cation diffusion facilitator family transporter  47.39 
 
 
355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00021391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0596  cation diffusion facilitator family transporter  51.6 
 
 
296 aa  219  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  28.93 
 
 
422 aa  139  6e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  29.35 
 
 
292 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  34.12 
 
 
317 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  27.41 
 
 
354 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  31.65 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  29.74 
 
 
388 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  31.77 
 
 
307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  31.12 
 
 
318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  27.15 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  27.15 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  27.63 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  25.81 
 
 
290 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  27.86 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  32.03 
 
 
385 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  32.12 
 
 
385 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  32.12 
 
 
385 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  30.2 
 
 
306 aa  112  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  27.86 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  28.79 
 
 
303 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  30.9 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  28.21 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.21 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.21 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  28.21 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  28.21 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  27.24 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  27.6 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  28.21 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  27.86 
 
 
297 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  28.57 
 
 
298 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  30.56 
 
 
396 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  30.56 
 
 
396 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  30.56 
 
 
396 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  30.56 
 
 
396 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  30.56 
 
 
396 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  30.56 
 
 
396 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  30.15 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  31.75 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  30.9 
 
 
418 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 
322 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  28.89 
 
 
337 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 
305 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.15 
 
 
378 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  26.88 
 
 
411 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  28.15 
 
 
378 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  27.24 
 
 
319 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  26.71 
 
 
299 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  32.03 
 
 
384 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  27.66 
 
 
307 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  27.66 
 
 
296 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 
418 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 
404 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 
404 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  25.98 
 
 
299 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  31.34 
 
 
318 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  24.23 
 
 
291 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
320 aa  106  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  26.71 
 
 
299 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 
423 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 
308 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  30.3 
 
 
400 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  25.63 
 
 
297 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
299 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  23.11 
 
 
291 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  24.3 
 
 
293 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 
310 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  26.2 
 
 
293 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  27.78 
 
 
311 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  27.59 
 
 
311 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  25.7 
 
 
292 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  25.91 
 
 
459 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  27.14 
 
 
317 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  27.2 
 
 
460 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 
299 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  29.64 
 
 
414 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 
298 aa  99  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  25.81 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  28.89 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>