More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1489 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
314 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  99.68 
 
 
340 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  99.68 
 
 
340 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3726  cation diffusion facilitator family transporter  85.53 
 
 
381 aa  524  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3225  cation diffusion facilitator family transporter  86.69 
 
 
356 aa  508  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1902  cation diffusion facilitator family transporter  86.64 
 
 
342 aa  501  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12062  hypothetical protein  76.03 
 
 
332 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4263  cation diffusion facilitator family transporter  61.84 
 
 
445 aa  354  8.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.961398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2352  cation diffusion facilitator family transporter  57.7 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.549755  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1898  cation diffusion facilitator family transporter  57.43 
 
 
371 aa  311  6.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338439  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5042  cation diffusion facilitator family transporter  58.39 
 
 
375 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1220  cation efflux family protein  50.68 
 
 
376 aa  296  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  49.66 
 
 
380 aa  294  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3649  cation efflux system protein  48.04 
 
 
384 aa  293  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.29953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2355  cation diffusion facilitator family transporter  57.69 
 
 
355 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00021391  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0284  cation diffusion facilitator family transporter  48.66 
 
 
341 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2329  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0596  cation diffusion facilitator family transporter  52.56 
 
 
296 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  28.68 
 
 
422 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 
354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  36.23 
 
 
305 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  25.43 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 
301 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  28.12 
 
 
411 aa  112  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  26.97 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  24.82 
 
 
381 aa  109  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  24.48 
 
 
293 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 
291 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  32.61 
 
 
303 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  32.21 
 
 
337 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  26.71 
 
 
401 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  29.15 
 
 
318 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  25.44 
 
 
291 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  29.32 
 
 
312 aa  102  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 
299 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  31.92 
 
 
309 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  32.48 
 
 
385 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 
320 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  25.17 
 
 
410 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  33.09 
 
 
317 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  32.48 
 
 
384 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  31.87 
 
 
385 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  31.87 
 
 
385 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 
450 aa  98.6  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  24.74 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  31.84 
 
 
423 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 
404 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  28.68 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 
404 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 
285 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  29.37 
 
 
389 aa  97.4  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  30.63 
 
 
318 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  24.74 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  31.5 
 
 
385 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 
328 aa  96.3  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  28.63 
 
 
296 aa  95.9  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
285 aa  95.9  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  25.63 
 
 
297 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  26.35 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  29.96 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  26.35 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.35 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.35 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  30.15 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  30.15 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  26.35 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  28.27 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  25.39 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  28.81 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  27.86 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  26.35 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 
308 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  29.58 
 
 
307 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  25.27 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  25.58 
 
 
319 aa  93.6  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 
306 aa  93.2  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  24.91 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 
299 aa  93.2  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  25.63 
 
 
297 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  25.99 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.74 
 
 
306 aa  92.4  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.62 
 
 
306 aa  92.4  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 
307 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  26.96 
 
 
391 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  29.04 
 
 
479 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  26.96 
 
 
391 aa  90.5  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  24.54 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  29.67 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>