More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5042 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5042  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 375 aa  719    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1898  cation diffusion facilitator family transporter  81.87 
 
 		 371 aa  555  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12062  hypothetical protein  57.84 
 
 		 332 aa  326  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  56.45 
 
 		 340 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  56.45 
 
 		 340 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  58.39 
 
 		 314 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3726  cation diffusion facilitator family transporter  53.43 
 
 		 381 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2352  cation diffusion facilitator family transporter  59.16 
 
 		 357 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.549755  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1902  cation diffusion facilitator family transporter  54.95 
 
 		 342 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3225  cation diffusion facilitator family transporter  57.14 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4263  cation diffusion facilitator family transporter  48.77 
 
 		 445 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.961398  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3649  cation efflux system protein  43.66 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.29953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2355  cation diffusion facilitator family transporter  54.39 
 
 		 355 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00021391  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1220  cation efflux family protein  48.96 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2329  cation diffusion facilitator family transporter  50.85 
 
 		 343 aa  263  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0284  cation diffusion facilitator family transporter  43.37 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  38.29 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0596  cation diffusion facilitator family transporter  48.59 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  28.09 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 		 305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  34.49 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  27.99 
 
 		 411 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  25.64 
 
 		 291 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  32.53 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  30.74 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  31.7 
 
 		 320 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  27.3 
 
 		 306 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  32.5 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  24.82 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  34.22 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 291 aa  99.8  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  24.57 
 
 		 291 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  27.17 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 		 337 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  26.06 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  24.47 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  21.74 
 
 		 293 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  28.38 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 404 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  30.54 
 
 		 300 aa  97.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  24.11 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 		 307 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  30.89 
 
 		 418 aa  96.7  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 		 307 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  28.11 
 
 		 346 aa  96.7  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.11 
 
 		 297 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 330 aa  96.3  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  24.11 
 
 		 297 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  23.91 
 
 		 298 aa  95.9  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  23.91 
 
 		 298 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  23.91 
 
 		 298 aa  95.9  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  28.03 
 
 		 307 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  30.61 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  31.13 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  27.65 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  31.13 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  31.13 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  31.13 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  31.13 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  22.05 
 
 		 290 aa  95.1  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 		 302 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  31.13 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  31.13 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  23.4 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  26.51 
 
 		 300 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  30.61 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  29.61 
 
 		 308 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  26.83 
 
 		 313 aa  94  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  30.19 
 
 		 423 aa  94  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  23.57 
 
 		 298 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  34.1 
 
 		 308 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  33.99 
 
 		 319 aa  92.8  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  33.99 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  35.45 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  26.84 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  27.21 
 
 		 380 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  23.59 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  32.89 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  27.21 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 		 385 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  24.84 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  26.56 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  27.21 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  28.21 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  30.29 
 
 		 400 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  23.7 
 
 		 319 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  33.79 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  29.02 
 
 		 320 aa  89.7  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  29.51 
 
 		 314 aa  89.7  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  37.06 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  30.77 
 
 		 298 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>