More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1509 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  100 
 
 		 314 aa  644    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  39.86 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 		 311 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  39.52 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  36.58 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  36.24 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  37.81 
 
 		 323 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  34.46 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  37.75 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  34.64 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  39.01 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  37.07 
 
 		 310 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  33.8 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  34.52 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.43 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  35.48 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  34.77 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  37.99 
 
 		 290 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  35.27 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  35.97 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  35.74 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  31.07 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  34.53 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  36.14 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  33.56 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  30.71 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  30.71 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  35.61 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 		 315 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  36.69 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  34.84 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  30.61 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  31.07 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  30.16 
 
 		 332 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  35.25 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  34.39 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  33.8 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  32.73 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  32.73 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  32.73 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  32.73 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  33.11 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  35.97 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  33.11 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  30.17 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  34.17 
 
 		 289 aa  152  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  31.74 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  32.75 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  32.01 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 289 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  32.58 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  30.14 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  32.73 
 
 		 312 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  35.21 
 
 		 290 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  33.57 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  34.88 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  33.69 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  35.21 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  34.41 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  35.25 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  34.86 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  31.13 
 
 		 476 aa  145  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  33.33 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  32.71 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  32.71 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  28.87 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 481 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  32.71 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  32.71 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  32.71 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  32.71 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  32.71 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  31.58 
 
 		 459 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  35.92 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  32.71 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  29.7 
 
 		 376 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  32.71 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  30.86 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  32.97 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>