More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2147 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  100 
 
 
380 aa  771    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3649  cation efflux system protein  79.63 
 
 
384 aa  608  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.29953 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1220  cation efflux family protein  63.09 
 
 
376 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2329  cation diffusion facilitator family transporter  55.35 
 
 
343 aa  341  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12062  hypothetical protein  48.1 
 
 
332 aa  293  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  49.66 
 
 
340 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  49.66 
 
 
340 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  49.66 
 
 
314 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2352  cation diffusion facilitator family transporter  50.64 
 
 
357 aa  288  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.549755  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3726  cation diffusion facilitator family transporter  48.68 
 
 
381 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1902  cation diffusion facilitator family transporter  49.18 
 
 
342 aa  278  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0284  cation diffusion facilitator family transporter  44.75 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1898  cation diffusion facilitator family transporter  45.21 
 
 
371 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338439  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5042  cation diffusion facilitator family transporter  46.2 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3225  cation diffusion facilitator family transporter  48.65 
 
 
356 aa  269  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4263  cation diffusion facilitator family transporter  49.1 
 
 
445 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.961398  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0596  cation diffusion facilitator family transporter  53.6 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2355  cation diffusion facilitator family transporter  45.37 
 
 
355 aa  239  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00021391  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 
422 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  27.93 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  28.79 
 
 
290 aa  124  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  28.41 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  33.33 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  28.98 
 
 
297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
318 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 
299 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  32.73 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  26.89 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  27.78 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  30.48 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  28.78 
 
 
299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  26.62 
 
 
299 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  23.98 
 
 
401 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  27.92 
 
 
297 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.27 
 
 
297 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  28.27 
 
 
297 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 
297 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  28.27 
 
 
298 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.27 
 
 
298 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  27.3 
 
 
297 aa  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  28.27 
 
 
298 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  31.23 
 
 
311 aa  113  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  28.12 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  29 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  29.21 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  27.46 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.22 
 
 
306 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  25.63 
 
 
294 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  26.95 
 
 
301 aa  110  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.22 
 
 
306 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  26.47 
 
 
296 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  27.02 
 
 
387 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  28.32 
 
 
346 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  26.89 
 
 
291 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  24.56 
 
 
293 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  27.51 
 
 
289 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  27.64 
 
 
289 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  26.64 
 
 
331 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  31.46 
 
 
289 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  26.91 
 
 
337 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  26.18 
 
 
313 aa  106  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  26.46 
 
 
310 aa  106  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  27.24 
 
 
299 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 
306 aa  106  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  26.81 
 
 
299 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  27.97 
 
 
309 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  26.16 
 
 
388 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
450 aa  103  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  28.93 
 
 
423 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  28.95 
 
 
328 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  26.81 
 
 
312 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  27.08 
 
 
313 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  26.71 
 
 
293 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  27.11 
 
 
317 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 
285 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  26.09 
 
 
299 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  27.5 
 
 
293 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  24.57 
 
 
292 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  26.84 
 
 
307 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  26.84 
 
 
307 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  27.11 
 
 
385 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  28.68 
 
 
297 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 
302 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  30.08 
 
 
301 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 
411 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  27.57 
 
 
385 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  27.57 
 
 
385 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  26.17 
 
 
303 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  25.19 
 
 
291 aa  99.4  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  26.84 
 
 
307 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  29.04 
 
 
295 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  26.44 
 
 
305 aa  97.1  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  26.35 
 
 
393 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  29.21 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>