More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0596 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0596  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
296 aa  564  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12062  hypothetical protein  50 
 
 
332 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0284  cation diffusion facilitator family transporter  52.8 
 
 
341 aa  276  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  52.56 
 
 
340 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1489  cation diffusion facilitator family transporter  52.56 
 
 
314 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1487  cation diffusion facilitator family transporter  52.56 
 
 
340 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  53.6 
 
 
380 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1902  cation diffusion facilitator family transporter  54.27 
 
 
342 aa  269  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3649  cation efflux system protein  50 
 
 
384 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.29953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3225  cation diffusion facilitator family transporter  53.15 
 
 
356 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3726  cation diffusion facilitator family transporter  50.87 
 
 
381 aa  258  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1220  cation efflux family protein  48.94 
 
 
376 aa  255  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2352  cation diffusion facilitator family transporter  50.68 
 
 
357 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.549755  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4263  cation diffusion facilitator family transporter  53.6 
 
 
445 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.961398  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2329  cation diffusion facilitator family transporter  51.6 
 
 
343 aa  229  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1898  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 
371 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338439  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5042  cation diffusion facilitator family transporter  52.38 
 
 
375 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2355  cation diffusion facilitator family transporter  53.98 
 
 
355 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00021391  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  27.13 
 
 
422 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  26.97 
 
 
354 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  26.04 
 
 
291 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 
291 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  23 
 
 
290 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  27.72 
 
 
292 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  26.26 
 
 
299 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  30.61 
 
 
411 aa  106  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  27.7 
 
 
299 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 
301 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  27.18 
 
 
410 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  23.43 
 
 
293 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 
294 aa  102  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  26.92 
 
 
299 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  27.37 
 
 
296 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 
305 aa  99.4  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  26.21 
 
 
292 aa  99  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  27.41 
 
 
460 aa  99  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  27.91 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  27.55 
 
 
307 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 
381 aa  96.3  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  29.88 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  31.16 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  30.94 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  30.23 
 
 
388 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 
378 aa  93.2  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.76 
 
 
378 aa  93.2  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  26.14 
 
 
319 aa  92.8  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  30.89 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  25.43 
 
 
401 aa  92.8  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 
299 aa  92.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  27.84 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  25.25 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
395 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 
322 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  28.12 
 
 
387 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  23.83 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  30.6 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  31 
 
 
298 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2257  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
416 aa  88.2  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  23.3 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  30.28 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  25.1 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  23.64 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  29.09 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  27.63 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  32.03 
 
 
298 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  29.06 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  34.89 
 
 
308 aa  86.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.27 
 
 
311 aa  87  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  29.12 
 
 
391 aa  86.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 
391 aa  86.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  25.27 
 
 
479 aa  86.3  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  31.48 
 
 
302 aa  85.9  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  29.54 
 
 
307 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  29.54 
 
 
307 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  29.18 
 
 
307 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  23.57 
 
 
293 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  23.57 
 
 
293 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  22.56 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  31.49 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  24.7 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.46 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0941  cation efflux protein  37.91 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.754529  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  24.91 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  22.22 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  27.51 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  25.42 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  22.53 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  23.47 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  22.22 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  22.22 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  22.18 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  22.53 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.37 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>