More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2257 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2257  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
416 aa  833    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0567  cation diffusion facilitator family transporter  52.81 
 
 
402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.714766  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1224  cation diffusion facilitator family transporter  44.53 
 
 
421 aa  292  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1276  cation diffusion facilitator family transporter  41.19 
 
 
416 aa  276  6e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3458  cation diffusion facilitator family transporter  37.82 
 
 
413 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  40.77 
 
 
396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 
381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  31.51 
 
 
410 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  33.53 
 
 
411 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1496  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 
400 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1214  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 
406 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0101557  hitchhiker  0.000000113777 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1417  cation diffusion facilitator family transporter  34.73 
 
 
384 aa  167  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0839  Co/Zn/Cd cation transporter  28.77 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000456084  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  25.54 
 
 
422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  26.98 
 
 
290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  28.12 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  30.63 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  30.39 
 
 
299 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  28.38 
 
 
378 aa  113  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.38 
 
 
378 aa  113  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  28.11 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1961  cation diffusion facilitator family transporter  27.75 
 
 
437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  28.47 
 
 
297 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 
318 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  30.8 
 
 
301 aa  110  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30.82 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 
323 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  28.11 
 
 
298 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  27.4 
 
 
297 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  29.12 
 
 
299 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  30.88 
 
 
289 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  26.79 
 
 
291 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 
297 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  27.76 
 
 
297 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  30.96 
 
 
311 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  26.21 
 
 
354 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  26.95 
 
 
291 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.17 
 
 
303 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  32.98 
 
 
296 aa  106  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  27.4 
 
 
297 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  27.4 
 
 
298 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.4 
 
 
297 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.4 
 
 
298 aa  106  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  27.4 
 
 
298 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  28.98 
 
 
292 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  30.88 
 
 
289 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  28.71 
 
 
401 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 
315 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 
306 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  29.96 
 
 
293 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  30.71 
 
 
308 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 
306 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  32.87 
 
 
296 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  29.96 
 
 
293 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 
320 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  27.87 
 
 
300 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
317 aa  103  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  27.05 
 
 
297 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  29.58 
 
 
299 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 
303 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  30 
 
 
311 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  32.41 
 
 
302 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  29.21 
 
 
296 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  29.21 
 
 
296 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  27.81 
 
 
303 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  29.21 
 
 
293 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  29.21 
 
 
296 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 
295 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  29.21 
 
 
293 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  29.21 
 
 
296 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  32.75 
 
 
305 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  29.21 
 
 
293 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 
309 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  25.85 
 
 
323 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 
307 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  28.05 
 
 
387 aa  100  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 
300 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  32.4 
 
 
307 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  26.32 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  30.88 
 
 
302 aa  97.8  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  30.56 
 
 
302 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 
302 aa  97.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  31.19 
 
 
317 aa  97.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  30.56 
 
 
302 aa  97.4  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  31.67 
 
 
300 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 
418 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  31.46 
 
 
295 aa  96.7  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  27.55 
 
 
310 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  32.35 
 
 
310 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 
307 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.87 
 
 
306 aa  95.5  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  29.68 
 
 
307 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 
307 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 
387 aa  95.5  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  28.46 
 
 
293 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  27.72 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  27.34 
 
 
293 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1511  cation diffusion facilitator family transporter  24.67 
 
 
340 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>