More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1131 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
324 aa  629  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  59 
 
 
329 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  57.86 
 
 
325 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  57.56 
 
 
332 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  59.35 
 
 
372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  58.33 
 
 
314 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  56.06 
 
 
320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  59.86 
 
 
314 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  56.82 
 
 
329 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  56.84 
 
 
339 aa  291  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  56.49 
 
 
337 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  58.1 
 
 
318 aa  290  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  51.31 
 
 
333 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  51.31 
 
 
333 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  56.68 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  51.22 
 
 
309 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 
300 aa  281  8.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  54.55 
 
 
356 aa  281  8.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  55.9 
 
 
318 aa  281  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  56.04 
 
 
322 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  57.54 
 
 
313 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  56.04 
 
 
322 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  48.98 
 
 
297 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 
366 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  51.92 
 
 
356 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  46.96 
 
 
373 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  51.58 
 
 
329 aa  272  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  55.25 
 
 
333 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  56.75 
 
 
346 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  52.78 
 
 
319 aa  268  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  54.98 
 
 
336 aa  263  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  50.99 
 
 
306 aa  262  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  52.13 
 
 
320 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  45.87 
 
 
307 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  45.85 
 
 
307 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  49.28 
 
 
306 aa  241  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  49.49 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  51.11 
 
 
335 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  46.85 
 
 
316 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  38.43 
 
 
314 aa  212  7e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  44.26 
 
 
309 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  41.09 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  37.68 
 
 
305 aa  197  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  39.58 
 
 
303 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  36.9 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  31.91 
 
 
299 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  35.35 
 
 
326 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  32.77 
 
 
299 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  32.25 
 
 
299 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 
308 aa  175  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 
299 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  37.58 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  35.57 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  36.84 
 
 
321 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  35.55 
 
 
299 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.91 
 
 
299 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  29.59 
 
 
294 aa  170  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 
314 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  31.58 
 
 
299 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  31.58 
 
 
299 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.58 
 
 
299 aa  168  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.01 
 
 
298 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  38.51 
 
 
321 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  31.58 
 
 
299 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  31.41 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  36.9 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  34.67 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.67 
 
 
300 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 
300 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  34.46 
 
 
301 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  34.46 
 
 
301 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  34.46 
 
 
301 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  34.46 
 
 
301 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  36.68 
 
 
325 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  38.33 
 
 
316 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 
300 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  36.77 
 
 
312 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  36.77 
 
 
312 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  36.77 
 
 
312 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  36.77 
 
 
312 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  37.29 
 
 
312 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  31.86 
 
 
312 aa  159  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  39.6 
 
 
306 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  38.18 
 
 
340 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  34.88 
 
 
299 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  34.27 
 
 
309 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.16 
 
 
304 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  32.42 
 
 
316 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  37.19 
 
 
312 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  37.19 
 
 
312 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  37.19 
 
 
312 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 
313 aa  155  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 
298 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 
306 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 
327 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  37.1 
 
 
339 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  39.56 
 
 
365 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  34.05 
 
 
305 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  40.89 
 
 
328 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>