More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0338 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  100 
 
 
305 aa  618  1e-176  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  40.83 
 
 
300 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  39.19 
 
 
296 aa  229  3e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  43.11 
 
 
329 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 
325 aa  222  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  43.21 
 
 
314 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
306 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 
339 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  40.69 
 
 
297 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  42.7 
 
 
318 aa  216  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  43.11 
 
 
320 aa  215  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  42.41 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  42.14 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  42.91 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  39.59 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  39.44 
 
 
328 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 
314 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  38.62 
 
 
322 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  38.62 
 
 
322 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 
333 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 
333 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  41.7 
 
 
336 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  39.85 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  41.87 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  42.25 
 
 
318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  42.36 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  41.4 
 
 
372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 
366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  38.75 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  38.75 
 
 
307 aa  195  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  37.15 
 
 
356 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  35.59 
 
 
314 aa  192  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  39.24 
 
 
306 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  42.36 
 
 
313 aa  188  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 
335 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  36.9 
 
 
302 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
346 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 
373 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  36.99 
 
 
303 aa  186  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 
319 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  32.44 
 
 
298 aa  180  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  36.11 
 
 
309 aa  175  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 
326 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.75 
 
 
304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  32.38 
 
 
331 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  34.15 
 
 
299 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  34.15 
 
 
299 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.15 
 
 
299 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  33.09 
 
 
299 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  32.36 
 
 
327 aa  160  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  33.33 
 
 
299 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  33.33 
 
 
299 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.15 
 
 
299 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  33.45 
 
 
295 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  33.8 
 
 
299 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  33.8 
 
 
299 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  30.93 
 
 
309 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  32.17 
 
 
312 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  33.8 
 
 
309 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  31.65 
 
 
299 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 
317 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  31.71 
 
 
311 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 
301 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  30.34 
 
 
301 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 
301 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 
301 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  31.62 
 
 
342 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  33.21 
 
 
298 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  31.38 
 
 
334 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 
316 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 
326 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  36.01 
 
 
316 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  36.01 
 
 
316 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  31.16 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  31.87 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  31.41 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0153  cation diffusion facilitator family transporter  31.38 
 
 
307 aa  146  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0646969  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  33.09 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  29.69 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  28.82 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.69 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 
325 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 
307 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
312 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  31.41 
 
 
314 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  32.82 
 
 
315 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  31.47 
 
 
321 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  32.01 
 
 
299 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  31.85 
 
 
312 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  32.38 
 
 
312 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  32.38 
 
 
312 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  33.09 
 
 
378 aa  140  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  30.1 
 
 
298 aa  139  4.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  29.08 
 
 
294 aa  139  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  30.07 
 
 
312 aa  138  1e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 
300 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 
311 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>