More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4540 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 346 aa  675    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  58.14 
 
 		 300 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  62.84 
 
 		 314 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  57.96 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  57.61 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  58.58 
 
 		 329 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  57.28 
 
 		 333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  57.28 
 
 		 333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  58.25 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  54.95 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  61.49 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  57.1 
 
 		 372 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  52.27 
 
 		 297 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  54.93 
 
 		 337 aa  306  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  54.6 
 
 		 339 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  58.61 
 
 		 329 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  59.72 
 
 		 322 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  59.72 
 
 		 322 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  59.08 
 
 		 318 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  55.52 
 
 		 306 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  58.67 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  57.34 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  58.11 
 
 		 314 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  57.35 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  52.49 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  52.86 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  53.42 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  59.18 
 
 		 313 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  56.77 
 
 		 302 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  54.87 
 
 		 366 aa  279  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  50.15 
 
 		 356 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  56.01 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  48.57 
 
 		 373 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  53.24 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  52.96 
 
 		 335 aa  268  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  52.67 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  49.84 
 
 		 309 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  48.03 
 
 		 307 aa  252  6e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  51.71 
 
 		 316 aa  252  8.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  48.03 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  43.01 
 
 		 303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  40 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  40.07 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  41.91 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  36.72 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  36.39 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  36.07 
 
 		 299 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  36.07 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  35.41 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.86 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.07 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  36.51 
 
 		 326 aa  185  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  34.49 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.18 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  34.49 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  34.86 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 		 309 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  36.99 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  35.13 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  35.59 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  38.25 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  40.83 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.94 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  34.94 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  38.31 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  41.55 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  36.93 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  36.09 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  34.8 
 
 		 299 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.09 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.09 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  36.09 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  36.31 
 
 		 365 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  34.49 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  39.34 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  37.76 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  36.15 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  36.98 
 
 		 331 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  36.59 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  35.25 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  38.43 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  37.29 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  38.43 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  28.35 
 
 		 398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  40.08 
 
 		 306 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  35.76 
 
 		 312 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  35.76 
 
 		 312 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  35.76 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>