More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3389 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  80.98 
 
 		 305 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  60.98 
 
 		 304 aa  332  6e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  60.06 
 
 		 307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  54.1 
 
 		 302 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  54.17 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  52.9 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  47.1 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  47.42 
 
 		 305 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  45.03 
 
 		 301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  45.03 
 
 		 301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  45.03 
 
 		 301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  45.03 
 
 		 301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  42.18 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  43.15 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  43.15 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  44.59 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  45.75 
 
 		 305 aa  232  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  43.05 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  44.18 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  44.6 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  40.82 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.17 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  40.97 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  40.97 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  40.62 
 
 		 299 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  48.07 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  42.43 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  44.77 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  43.88 
 
 		 313 aa  212  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  41.89 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  41.51 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.51 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  41.13 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  43.36 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  41.51 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4981  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  45.8 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  41.06 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.06 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.51 
 
 		 299 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  43.42 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  42.48 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  42.48 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  42.48 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  41.5 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  41.5 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  42.37 
 
 		 307 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  40.82 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  46.59 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  43.69 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  40.2 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  45.48 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  41 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  38.81 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  42.53 
 
 		 306 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09800  cation diffusion facilitator family transporter  46.62 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.492216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  35.93 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  37.02 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  41.55 
 
 		 356 aa  188  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  36.64 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.27 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 327 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  42.01 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.27 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0452  cation diffusion facilitator family transporter  39.5 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0402588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0231  cation diffusion facilitator family transporter  42 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  36.68 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  40.71 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  43.94 
 
 		 299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  40.68 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  36.1 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  39.46 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 317 aa  178  9e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  36.05 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  33.22 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  36.92 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  39.15 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  37.72 
 
 		 298 aa  176  6e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  37.46 
 
 		 312 aa  175  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  37.46 
 
 		 312 aa  175  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  41.2 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  39.58 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  37.46 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  38.59 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  40 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  32.87 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  37.19 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  35.48 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  30.99 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  37.41 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>