More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0525 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
306 aa  591  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  52.92 
 
 
308 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  59.64 
 
 
300 aa  296  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  52.29 
 
 
306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  54.58 
 
 
300 aa  277  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  51.61 
 
 
304 aa  277  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  57.52 
 
 
307 aa  271  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  48.68 
 
 
308 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  54.02 
 
 
308 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  52.82 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  45.67 
 
 
326 aa  253  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  46.41 
 
 
305 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  48.81 
 
 
340 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  47.19 
 
 
304 aa  245  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  43.19 
 
 
299 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  48.05 
 
 
305 aa  236  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  53.16 
 
 
303 aa  236  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  42.32 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  42.32 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  42.32 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  42.32 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  44.21 
 
 
305 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  43.73 
 
 
312 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  43.99 
 
 
300 aa  230  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  43.99 
 
 
300 aa  230  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 
307 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  48.2 
 
 
306 aa  230  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  43.85 
 
 
299 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  45.36 
 
 
305 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  43.48 
 
 
305 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  43.48 
 
 
305 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  42.86 
 
 
305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 
307 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  41.04 
 
 
313 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  39.35 
 
 
315 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  46.73 
 
 
304 aa  222  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19860  cation diffusion facilitator family transporter  48.17 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163356  decreased coverage  0.00158825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  46.03 
 
 
307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  42.03 
 
 
302 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  38.99 
 
 
342 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  47.14 
 
 
313 aa  218  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  45.97 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  35.88 
 
 
299 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  43.69 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  35.67 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  35.55 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  35.67 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  42.95 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  42.95 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  43.85 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36700  cation diffusion facilitator family transporter  47.59 
 
 
313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  35.67 
 
 
299 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 
305 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4510  cation diffusion facilitator family transporter  51.88 
 
 
247 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.33 
 
 
299 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  35.33 
 
 
299 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.33 
 
 
299 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  35.33 
 
 
299 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  42 
 
 
298 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  42 
 
 
298 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  42 
 
 
298 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  47.32 
 
 
299 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  39.93 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  46.32 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  40.86 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  38.11 
 
 
298 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 
327 aa  200  3e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  39.6 
 
 
347 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  38.97 
 
 
331 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  40.48 
 
 
322 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  40.48 
 
 
322 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  34.92 
 
 
295 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  38.16 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  43.42 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  43.52 
 
 
297 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  43.52 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  44.07 
 
 
305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  41.47 
 
 
299 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  41.01 
 
 
366 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  40.39 
 
 
325 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  40.44 
 
 
334 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  38.27 
 
 
315 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  43.36 
 
 
309 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  39.79 
 
 
312 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  41.08 
 
 
303 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  41.55 
 
 
356 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  40.99 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
309 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  38.62 
 
 
320 aa  189  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  36.86 
 
 
298 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 
342 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 
312 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0231  cation diffusion facilitator family transporter  42.47 
 
 
307 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  37.23 
 
 
298 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  41.52 
 
 
313 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  38.44 
 
 
332 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  32.77 
 
 
298 aa  185  8e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 
373 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.499845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>