More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0171 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 307 aa  599  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  88.6 
 
 		 304 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  58.63 
 
 		 302 aa  352  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  67.35 
 
 		 305 aa  347  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  60.06 
 
 		 305 aa  345  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  58.45 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  59.93 
 
 		 307 aa  289  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  47.23 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  47.1 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  47.1 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  47.1 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  47.1 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  46.6 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  47.35 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  46.25 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  46.25 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  46.25 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  43.52 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  46.26 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  48.36 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  44.93 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  47.4 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 		 305 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 		 305 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  45.02 
 
 		 326 aa  232  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  44.36 
 
 		 305 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  45.68 
 
 		 307 aa  232  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0231  cation diffusion facilitator family transporter  48.34 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  40.66 
 
 		 327 aa  223  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  37.7 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  43.19 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  37.38 
 
 		 299 aa  221  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  44.26 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  37.38 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4981  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  48.76 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  47.9 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  38.43 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.36 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  42.36 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  44.19 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  43.59 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  43.2 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  41.55 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  39.85 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  37.38 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.05 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  37.38 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.05 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  37.45 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  44.3 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  36.72 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  43.42 
 
 		 316 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  43.42 
 
 		 316 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09800  cation diffusion facilitator family transporter  49.5 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.492216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  44.62 
 
 		 327 aa  202  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  45.83 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  35.31 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  36.59 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  40.14 
 
 		 378 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  41.28 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0452  cation diffusion facilitator family transporter  38.82 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0402588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  41.51 
 
 		 333 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  43.16 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  40.53 
 
 		 297 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  40.5 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  48.47 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.91 
 
 		 297 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  39.36 
 
 		 352 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  41.37 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.91 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  38.36 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  41.1 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  37.41 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  46.82 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  38.69 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  42.53 
 
 		 325 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  42.57 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  34.8 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  41.98 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  38.7 
 
 		 298 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  36.81 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  36.81 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  43.77 
 
 		 307 aa  178  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  36.81 
 
 		 312 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  38.74 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  41.64 
 
 		 340 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  34.35 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  38.69 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  35.99 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  34.35 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  45.76 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  37.11 
 
 		 306 aa  176  6e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  32.92 
 
 		 398 aa  175  9e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>