More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6782 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
305 aa  611  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  51.6 
 
 
313 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  44.91 
 
 
326 aa  249  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  48.4 
 
 
305 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.32 
 
 
304 aa  245  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  46.48 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  46.48 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  46.5 
 
 
316 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  46.5 
 
 
316 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  44.56 
 
 
301 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  44.56 
 
 
301 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  44.56 
 
 
301 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  44.56 
 
 
301 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  46.26 
 
 
305 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  48.41 
 
 
299 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  45.16 
 
 
302 aa  235  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  41.55 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  42.4 
 
 
299 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  44.11 
 
 
307 aa  232  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  44.18 
 
 
305 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  43.11 
 
 
299 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  43.73 
 
 
314 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  44.22 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  41.52 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  50.6 
 
 
319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  40.35 
 
 
311 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  48.01 
 
 
299 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  44.91 
 
 
309 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 
300 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.16 
 
 
300 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  39.6 
 
 
303 aa  216  4e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 
315 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  45.73 
 
 
305 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  43.12 
 
 
297 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  44.21 
 
 
306 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  36.21 
 
 
299 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  38.99 
 
 
342 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  41.7 
 
 
308 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  35.86 
 
 
299 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  36.55 
 
 
299 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  39.73 
 
 
305 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  41.2 
 
 
300 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  45.26 
 
 
297 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  35.86 
 
 
299 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  40.42 
 
 
309 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  45.26 
 
 
297 aa  202  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  43.23 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  35.87 
 
 
299 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  35.87 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  35.51 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  35.51 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  35.39 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.51 
 
 
299 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.14 
 
 
299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  39.16 
 
 
305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  39.55 
 
 
315 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  40.83 
 
 
306 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  39.86 
 
 
312 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  38.73 
 
 
304 aa  192  6e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 
316 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  37.76 
 
 
332 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  39.22 
 
 
317 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 
298 aa  189  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 
326 aa  188  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  38.17 
 
 
325 aa  188  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 
328 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 
298 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  39.26 
 
 
333 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  38.99 
 
 
321 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 
300 aa  186  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  39.76 
 
 
340 aa  185  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  43.27 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  41.69 
 
 
308 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  38.58 
 
 
298 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  38.58 
 
 
298 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  36.59 
 
 
314 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  38.58 
 
 
298 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  38.06 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  35.23 
 
 
314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  36.71 
 
 
331 aa  182  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 
309 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  37.91 
 
 
378 aa  182  8.000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  35.25 
 
 
312 aa  182  9.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 
347 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  37.16 
 
 
312 aa  181  1e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  35.86 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  36.82 
 
 
334 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 
307 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0460  cation efflux system protein CzcD  36.86 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  33.68 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  35.9 
 
 
314 aa  179  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 
352 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1727  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.86 
 
 
297 aa  179  8e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4981  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  40.58 
 
 
303 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  39.15 
 
 
626 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>