More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1952 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 298 aa  590  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  41.94 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  39.16 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  41.26 
 
 		 284 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  40.91 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  40.78 
 
 		 300 aa  221  9e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  37.99 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  38.25 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  34.81 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  39.35 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  37.19 
 
 		 298 aa  188  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  32.74 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  29.11 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  32.63 
 
 		 326 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  30.51 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  35.66 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  34.97 
 
 		 342 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  32.65 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0922  cation efflux protein  35.91 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.134705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  32.65 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  31.08 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.93 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  28.82 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  32.65 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  30.14 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.75 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  34.2 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.82 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.21 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  29.43 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  33.21 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  32.82 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  32.82 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  34.95 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  31.08 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  30.64 
 
 		 317 aa  162  9e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  29.7 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  32.88 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  29.62 
 
 		 366 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  33.83 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  33.45 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  27.18 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  35.19 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  31.01 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 335 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  29.59 
 
 		 300 aa  159  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  31.06 
 
 		 306 aa  159  8e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0020  cation efflux family protein  34.66 
 
 		 314 aa  159  8e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 314 aa  158  9e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  28.77 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  28.77 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  27.11 
 
 		 332 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  28.81 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  29.5 
 
 		 329 aa  155  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  33.1 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  29.27 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0567  cation efflux family protein  33.8 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.609101  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  27.62 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  28.17 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  31.82 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  29.11 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  28.01 
 
 		 356 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  34.09 
 
 		 378 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  30.77 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  29.31 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1433  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 		 365 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  27.21 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  32.4 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  32.4 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  35.92 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>