More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4080 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 295 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  56.84 
 
 		 300 aa  332  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  42.31 
 
 		 302 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  36.39 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  37.31 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  35.11 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  37.96 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  38.32 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  34.53 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  33.1 
 
 		 299 aa  185  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  33.1 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  32.75 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  32.4 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  34.35 
 
 		 312 aa  178  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  33.1 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.75 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.1 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  32.75 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  29.37 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  32.75 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  32.23 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  33.09 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  30.87 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  32.77 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  32.95 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  30.66 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  30.66 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  31.52 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  34.66 
 
 		 294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2807  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  32.17 
 
 		 366 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.56 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  32.07 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  32.77 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 336 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  31.45 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  32.74 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  29.67 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  29.67 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  29.67 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  29.67 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  30.43 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  29.33 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  32.75 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  30.66 
 
 		 316 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  29.62 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  32.23 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  30.07 
 
 		 315 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  32.09 
 
 		 321 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 		 328 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  29.66 
 
 		 314 aa  155  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  34.91 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  34.91 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  31.21 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1433  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  30.85 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.32 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  28.82 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  31.87 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  30.27 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  32.19 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  31.06 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  30.42 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  32.06 
 
 		 356 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  33.96 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  31.47 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  28.99 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  30.45 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  32.51 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  30.61 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  29.89 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  30.99 
 
 		 356 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  31.01 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>