More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1430 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
322 aa  627  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
322 aa  627  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  81.98 
 
 
333 aa  467  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  81.98 
 
 
333 aa  467  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  60 
 
 
329 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  64.24 
 
 
314 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  59.12 
 
 
300 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  62.5 
 
 
332 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  62.46 
 
 
318 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  58.23 
 
 
372 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  56.74 
 
 
325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  62.85 
 
 
329 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  56.95 
 
 
320 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  59.93 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  60.42 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  55.73 
 
 
319 aa  311  9e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  59.03 
 
 
366 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  60.76 
 
 
318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  58.6 
 
 
309 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  56.01 
 
 
328 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  60.2 
 
 
313 aa  299  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  55.9 
 
 
329 aa  298  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  57.45 
 
 
356 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  61.37 
 
 
339 aa  295  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  58.13 
 
 
336 aa  292  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  60.65 
 
 
337 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  51.49 
 
 
297 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  51.82 
 
 
306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  50.3 
 
 
373 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  56.25 
 
 
320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  59.04 
 
 
346 aa  282  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  55.76 
 
 
324 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  53.72 
 
 
356 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  57.93 
 
 
333 aa  272  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  48.79 
 
 
335 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  52.35 
 
 
302 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  50.52 
 
 
316 aa  242  7e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  46.6 
 
 
309 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  47.42 
 
 
307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  47.08 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  41.9 
 
 
311 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  42.35 
 
 
303 aa  209  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  38.62 
 
 
305 aa  205  9e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  39.21 
 
 
314 aa  204  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  40.64 
 
 
296 aa  203  4e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  37.87 
 
 
299 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  42.63 
 
 
339 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  37.87 
 
 
299 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  37.54 
 
 
299 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  37.87 
 
 
299 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  38.98 
 
 
299 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  37.87 
 
 
299 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  37.54 
 
 
299 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  37.54 
 
 
299 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.88 
 
 
299 aa  185  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.21 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  37.32 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  41.28 
 
 
306 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.05 
 
 
304 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  36.65 
 
 
315 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  36.62 
 
 
326 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37.55 
 
 
307 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  38.98 
 
 
299 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  32.41 
 
 
298 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 
300 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.46 
 
 
300 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  31.99 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  35.66 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  34.63 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  34.25 
 
 
316 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  35.07 
 
 
301 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 
301 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 
301 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  37.01 
 
 
321 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 
301 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  39.25 
 
 
365 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  38.93 
 
 
325 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  38.01 
 
 
306 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  35.66 
 
 
334 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  39.45 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 
295 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  35.76 
 
 
312 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  37.16 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  38.23 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 
335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 
309 aa  162  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  37.14 
 
 
298 aa  162  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  36.07 
 
 
378 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 
308 aa  162  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  31.46 
 
 
347 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  38.17 
 
 
314 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0460  cation efflux system protein CzcD  37.5 
 
 
297 aa  159  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  40.78 
 
 
356 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  32.96 
 
 
311 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1727  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.5 
 
 
297 aa  159  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 
326 aa  159  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  35.23 
 
 
315 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>