More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3476 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
328 aa  644    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  59.4 
 
 
300 aa  352  5e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  57.72 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  61.19 
 
 
314 aa  325  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  56.66 
 
 
332 aa  322  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  55.41 
 
 
333 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  55.41 
 
 
333 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  56.58 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  55.52 
 
 
372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  58.25 
 
 
346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  54.9 
 
 
309 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  60.57 
 
 
339 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  56.45 
 
 
322 aa  295  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  56.45 
 
 
322 aa  295  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  59.51 
 
 
320 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  59.86 
 
 
337 aa  292  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  59.79 
 
 
313 aa  291  9e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  53.8 
 
 
320 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  53.05 
 
 
329 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  56.29 
 
 
314 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  57.2 
 
 
318 aa  286  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  56.99 
 
 
318 aa  285  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  56.68 
 
 
324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  50.18 
 
 
297 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  56.16 
 
 
336 aa  279  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  53.38 
 
 
366 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  47.52 
 
 
356 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  52.11 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  52.31 
 
 
373 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  53.31 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  53.29 
 
 
356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  52.26 
 
 
319 aa  263  4e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  56.75 
 
 
333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  45.87 
 
 
307 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 
302 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  45.87 
 
 
307 aa  245  6.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  47.7 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  49.53 
 
 
335 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  46.28 
 
 
309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  48.44 
 
 
316 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  38.93 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  43.53 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  42.7 
 
 
311 aa  212  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  39.44 
 
 
305 aa  209  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  38.49 
 
 
303 aa  192  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  39.77 
 
 
325 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 
305 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  41.24 
 
 
321 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  36.68 
 
 
299 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
298 aa  186  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  37.37 
 
 
299 aa  185  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  37.37 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  40.78 
 
 
342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  36.33 
 
 
299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  36.49 
 
 
326 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.96 
 
 
304 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
314 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  36.68 
 
 
299 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  34.56 
 
 
300 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.99 
 
 
299 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.33 
 
 
299 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  38.77 
 
 
307 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  35.21 
 
 
299 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  35.21 
 
 
299 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  37.33 
 
 
312 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  37.74 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  42.11 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  39.87 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  37.04 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  35.69 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  34.72 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  38.31 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  40.82 
 
 
305 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 
327 aa  171  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  40.82 
 
 
305 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  35.09 
 
 
301 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.09 
 
 
301 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.09 
 
 
301 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  35.09 
 
 
301 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  36.18 
 
 
317 aa  169  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 
294 aa  169  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  38.03 
 
 
297 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  36.76 
 
 
365 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 
342 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.36 
 
 
300 aa  168  9e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 
300 aa  168  9e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  34.3 
 
 
315 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  35.91 
 
 
311 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  34.93 
 
 
298 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  36.76 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
316 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  37.37 
 
 
299 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  36.75 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 
305 aa  165  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  38.83 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  38.32 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  33.09 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 
347 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  38.19 
 
 
342 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>