More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3614 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 332 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  83.44 
 
 		 314 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  68.31 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  69.87 
 
 		 329 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  71.33 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  67.08 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  65.99 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  70.63 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  68.84 
 
 		 372 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  68.38 
 
 		 314 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  69.1 
 
 		 318 aa  359  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  70 
 
 		 313 aa  351  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  66.1 
 
 		 318 aa  349  5e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  68.94 
 
 		 333 aa  346  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  57.38 
 
 		 300 aa  342  4e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  59.43 
 
 		 333 aa  341  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  59.43 
 
 		 333 aa  341  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  62.5 
 
 		 322 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  62.5 
 
 		 322 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  57.52 
 
 		 319 aa  325  6e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  59.21 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  55.91 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  60.35 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  57.64 
 
 		 329 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  61.62 
 
 		 346 aa  316  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  58.97 
 
 		 366 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  59.85 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  57.34 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  51.96 
 
 		 373 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  59.38 
 
 		 336 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  50.84 
 
 		 297 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  56.55 
 
 		 306 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  56.08 
 
 		 356 aa  291  7e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  58.08 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  55.78 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  55.21 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  51.2 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  47.54 
 
 		 309 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  44.52 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  44.98 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  38.85 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  41.7 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  42.14 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  39.8 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  38.49 
 
 		 296 aa  207  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  36.11 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  36.46 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  38.57 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  41.96 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  42.45 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  36.11 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  36.11 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  35.42 
 
 		 342 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  38.36 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  38.05 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  35.76 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  35.76 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.76 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.42 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.62 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  38.24 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  35.42 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  36.23 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.41 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  38.49 
 
 		 305 aa  182  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  37.09 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  38.7 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  35.97 
 
 		 312 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 316 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  39.73 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  32.79 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  32.79 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  32.79 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  32.79 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 347 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  37.71 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 		 313 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  41.86 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  35.37 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  35.37 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  38.35 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  36.56 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  42.23 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  36.04 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1837  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  35.58 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  40.12 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  36.93 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  36.93 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  38.64 
 
 		 304 aa  165  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>