More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4073 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 318 aa  624  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  68.75 
 
 		 329 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  64.63 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  69.1 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  68.4 
 
 		 314 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  67.71 
 
 		 372 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  67.83 
 
 		 339 aa  358  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  67.83 
 
 		 337 aa  358  8e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  61.72 
 
 		 320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  67.01 
 
 		 314 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  67.01 
 
 		 329 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  56.44 
 
 		 300 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  60.76 
 
 		 322 aa  329  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  60.76 
 
 		 322 aa  329  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  61.99 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  62.79 
 
 		 313 aa  326  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  66.55 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  58.04 
 
 		 333 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  58.04 
 
 		 333 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  52.86 
 
 		 297 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  61.01 
 
 		 336 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  56.25 
 
 		 329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  57.88 
 
 		 319 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  56.99 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  55.12 
 
 		 309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  56.94 
 
 		 306 aa  298  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  56.94 
 
 		 324 aa  298  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  57.39 
 
 		 366 aa  295  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  59.73 
 
 		 346 aa  295  9e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  56.79 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  54.39 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  56.74 
 
 		 356 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  56 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  54.96 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  52.41 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  47.88 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  52.54 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  52.45 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  39.51 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  44.48 
 
 		 303 aa  229  6e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  42.25 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  42.12 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  41.44 
 
 		 307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  38.83 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  38.33 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  37.29 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  37.62 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  37.62 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.62 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.29 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  37.29 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  37.29 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  40.8 
 
 		 326 aa  198  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  36.96 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  38.46 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  38.54 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  38.89 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.93 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 342 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 321 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  34.41 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  43.16 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  38.05 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  37.84 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  37.24 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  37.24 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  37.24 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  37.24 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37.77 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  39.01 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  34.95 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  37.74 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  38.21 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  34.84 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  36.63 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  39.54 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  36.07 
 
 		 311 aa  168  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  38.06 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  38.06 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  41.33 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  36.29 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  38.06 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  38.06 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  37.72 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  34.3 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  34.3 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  34.3 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  36.99 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  37.71 
 
 		 342 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.03 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  34.98 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  37.71 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>