More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2131 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 305 aa  610  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 305 aa  610  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  62.59 
 
 		 305 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  60.28 
 
 		 305 aa  340  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  62.99 
 
 		 299 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  60.28 
 
 		 313 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  55.16 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  55.16 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  55.16 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  55.16 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  47.45 
 
 		 326 aa  262  4.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  45.94 
 
 		 304 aa  255  7e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  46.48 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  44.56 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  44.86 
 
 		 302 aa  248  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  43.15 
 
 		 305 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  46.34 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  46.34 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  42.96 
 
 		 299 aa  234  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  45.02 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  42.96 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  42.21 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  42.6 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  46.13 
 
 		 309 aa  231  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  42.6 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  45.74 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  44.64 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  43.92 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  42.55 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  49.63 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  39.65 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  49.63 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  41.99 
 
 		 333 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  39.3 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  45.49 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  42.75 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  41.23 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  41.61 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  42.75 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.61 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  42.75 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.75 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  43.97 
 
 		 352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  42.75 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.37 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  41.79 
 
 		 340 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  40.5 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  40.5 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  40.44 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  43.21 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  39.85 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  46.67 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  44.18 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 		 314 aa  212  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  42.18 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  42.65 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  43.68 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  39.01 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  40.77 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  44.2 
 
 		 319 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  43.1 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  41.11 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  43.01 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  40.56 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  42.23 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  41.52 
 
 		 315 aa  202  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  35.78 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  43.37 
 
 		 321 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  42.4 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  41.09 
 
 		 313 aa  198  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  37.86 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  41.24 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  41.24 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  41.24 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  42.28 
 
 		 328 aa  192  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  39.18 
 
 		 378 aa  191  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  41.45 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  40.22 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  41.09 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  41.09 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  41.09 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  41.09 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  41.09 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  33.7 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  41.09 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  40.61 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  39.7 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 		 301 aa  188  8e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  39.24 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  39.24 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  39.24 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  39.24 
 
 		 312 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  39.24 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  37.96 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 325 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  38.54 
 
 		 325 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  39.45 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>