More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0184 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
304 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  88.6 
 
 
307 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  59.87 
 
 
302 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  66.99 
 
 
305 aa  353  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  60.98 
 
 
305 aa  350  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  61.03 
 
 
309 aa  315  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  59.79 
 
 
307 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  50.99 
 
 
303 aa  278  9e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 
301 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  47.68 
 
 
301 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 
301 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 
301 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  48.11 
 
 
305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  48.2 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  47.33 
 
 
299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  49.51 
 
 
305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  46.18 
 
 
305 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  44.9 
 
 
299 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  45.02 
 
 
305 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  48.92 
 
 
299 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  45.02 
 
 
305 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  44.22 
 
 
305 aa  235  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  43.85 
 
 
326 aa  235  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  47.37 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  45.9 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  45.9 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  45.9 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  41.64 
 
 
327 aa  229  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4981  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  51.75 
 
 
303 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  45.99 
 
 
304 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 
307 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0231  cation diffusion facilitator family transporter  48 
 
 
307 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 
300 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  44.22 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  43.06 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  43.06 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09800  cation diffusion facilitator family transporter  52.67 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.492216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  49.64 
 
 
300 aa  219  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  43.55 
 
 
312 aa  217  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  38.91 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  44.3 
 
 
304 aa  215  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  45.63 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  38.57 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  38.23 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  39.25 
 
 
299 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  39.77 
 
 
342 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  45.76 
 
 
327 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  39.15 
 
 
315 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  41.28 
 
 
315 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  46.46 
 
 
306 aa  205  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  43.09 
 
 
297 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.23 
 
 
299 aa  205  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  43.84 
 
 
297 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  38.23 
 
 
299 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  38.23 
 
 
299 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  43.49 
 
 
316 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  43.49 
 
 
316 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.23 
 
 
299 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  44.2 
 
 
325 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  43.84 
 
 
297 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  38.93 
 
 
295 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  46.26 
 
 
306 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  41.81 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  37.88 
 
 
299 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0452  cation diffusion facilitator family transporter  41.14 
 
 
309 aa  199  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0402588  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  44.14 
 
 
299 aa  199  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  44.72 
 
 
356 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  45.36 
 
 
319 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  41.89 
 
 
333 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  35.59 
 
 
306 aa  193  3e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 
352 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  41.38 
 
 
340 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  46.28 
 
 
307 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  37.68 
 
 
298 aa  192  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  43.1 
 
 
305 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  39.94 
 
 
308 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  36.23 
 
 
312 aa  191  1e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  41.87 
 
 
314 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 
317 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  41.22 
 
 
378 aa  191  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  46.49 
 
 
308 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  39.07 
 
 
298 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  48.47 
 
 
307 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  41.1 
 
 
321 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  38.8 
 
 
347 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 
326 aa  186  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  36.65 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  41.92 
 
 
340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 
319 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 
319 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  37.62 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  37.81 
 
 
309 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  42.41 
 
 
306 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  38.71 
 
 
309 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  43.11 
 
 
313 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  45.97 
 
 
303 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  42.28 
 
 
305 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  36.51 
 
 
359 aa  175  7e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0111845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>