More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0517 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
298 aa  583  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
298 aa  583  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
298 aa  583  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  86.2 
 
 
299 aa  474  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0231  cation diffusion facilitator family transporter  86.24 
 
 
307 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  57.8 
 
 
305 aa  317  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  45.21 
 
 
302 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  48.78 
 
 
307 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  50.17 
 
 
309 aa  242  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  46.25 
 
 
307 aa  242  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  46.49 
 
 
303 aa  238  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  45.9 
 
 
304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  42.48 
 
 
305 aa  218  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  45.42 
 
 
305 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  44.7 
 
 
305 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  40.62 
 
 
299 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4981  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  45.26 
 
 
303 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  41.24 
 
 
305 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  41.24 
 
 
305 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  41.58 
 
 
305 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  38.58 
 
 
305 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  40 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  40.97 
 
 
299 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  39.19 
 
 
327 aa  189  4e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  40.28 
 
 
326 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  38.96 
 
 
308 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  39.5 
 
 
312 aa  189  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.7 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  40.97 
 
 
299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  40.44 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  34.13 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  44.14 
 
 
306 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  34.36 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 
342 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  39.07 
 
 
316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  39.07 
 
 
316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  34.26 
 
 
299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  37.77 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 
315 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 
304 aa  181  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  32.55 
 
 
299 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  39 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  32.89 
 
 
299 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  32.89 
 
 
299 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.55 
 
 
299 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 
308 aa  175  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  37.87 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.01 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.55 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.01 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 
299 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 
300 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  32.65 
 
 
299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 
300 aa  169  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.29 
 
 
300 aa  169  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  32.36 
 
 
295 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09800  cation diffusion facilitator family transporter  43.17 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.492216  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  33.58 
 
 
378 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  36 
 
 
347 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  33.21 
 
 
306 aa  161  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  34.97 
 
 
326 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  34.45 
 
 
313 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  36.93 
 
 
321 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  35.04 
 
 
315 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  34.88 
 
 
312 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  37.72 
 
 
356 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  40.3 
 
 
300 aa  159  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 
309 aa  158  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  42.8 
 
 
319 aa  159  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  34.77 
 
 
334 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  38.69 
 
 
310 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  34.95 
 
 
312 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  34.95 
 
 
312 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  34.95 
 
 
312 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 
297 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  36.14 
 
 
340 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  34.56 
 
 
309 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
307 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  33.33 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 
298 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4374  cation diffusion facilitator family transporter  37.36 
 
 
347 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  36 
 
 
332 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  39.15 
 
 
328 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 
311 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 
305 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 
325 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  29.01 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  37.32 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  39 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  29.31 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
303 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4043  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 
328 aa  145  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3767  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 
328 aa  145  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.784386  normal  0.408109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>