More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1148 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
340 aa  685    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  83.56 
 
 
333 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  67.39 
 
 
352 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  51.86 
 
 
325 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  52.61 
 
 
325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  49.3 
 
 
298 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  48.57 
 
 
312 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  48.57 
 
 
312 aa  259  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  48.57 
 
 
312 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  45.31 
 
 
310 aa  255  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  44.98 
 
 
321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  43 
 
 
299 aa  252  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  51.82 
 
 
310 aa  251  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  44.88 
 
 
312 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  42.35 
 
 
299 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  42.62 
 
 
299 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  46.96 
 
 
327 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  45.43 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  45.43 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  45.43 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  47.6 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  45.11 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  45.11 
 
 
312 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  40.21 
 
 
312 aa  241  1e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  45.51 
 
 
316 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  41.14 
 
 
299 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.35 
 
 
299 aa  236  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  42.02 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.02 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  40.56 
 
 
298 aa  232  7.000000000000001e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  41.37 
 
 
299 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  41.37 
 
 
299 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  38.31 
 
 
398 aa  231  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 
325 aa  228  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  39 
 
 
306 aa  227  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  42.45 
 
 
295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  47.29 
 
 
313 aa  225  7e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  39.8 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
342 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  39.19 
 
 
299 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  41.79 
 
 
305 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  41.79 
 
 
305 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  38.99 
 
 
315 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  44.1 
 
 
316 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  44.1 
 
 
316 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  40.94 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  47.65 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  47.29 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  47.65 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  47.65 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  47.65 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  47.65 
 
 
313 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  47.65 
 
 
313 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  38.8 
 
 
312 aa  209  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  39.1 
 
 
301 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 
301 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 
301 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 
301 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  39.26 
 
 
314 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  41.81 
 
 
378 aa  207  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  39.93 
 
 
315 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  39.88 
 
 
359 aa  205  9e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  38.7 
 
 
305 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  40.2 
 
 
299 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  38.78 
 
 
299 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.86 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 
305 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  36.55 
 
 
316 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  39.66 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 
325 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 
326 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 
325 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 
328 aa  196  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 
311 aa  195  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  37.72 
 
 
300 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 
307 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 
321 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  38.36 
 
 
302 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  40.79 
 
 
339 aa  193  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  41.14 
 
 
304 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  39.43 
 
 
317 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.32 
 
 
304 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  41.08 
 
 
297 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.26 
 
 
297 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.26 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  36.81 
 
 
309 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  36.92 
 
 
305 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  33.55 
 
 
326 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  38.69 
 
 
316 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 
317 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  38.32 
 
 
316 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 
332 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  40.69 
 
 
626 aa  179  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  34.56 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  34.56 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  38.74 
 
 
306 aa  179  7e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 
317 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>