More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4903 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 308 aa  597  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  73.56 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  66.34 
 
 		 304 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  72.44 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  60.32 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  70.55 
 
 		 307 aa  358  6e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  63.31 
 
 		 305 aa  348  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  62 
 
 		 305 aa  345  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36700  cation diffusion facilitator family transporter  66.24 
 
 		 313 aa  338  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19860  cation diffusion facilitator family transporter  55.66 
 
 		 308 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163356  decreased coverage  0.00158825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  50.65 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  49.18 
 
 		 312 aa  281  8.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  50.32 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  54.79 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  50.32 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0669  cation diffusion facilitator family transporter  52.76 
 
 		 343 aa  245  6.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  48.82 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  43.48 
 
 		 301 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  43.48 
 
 		 301 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  43.48 
 
 		 301 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  43.48 
 
 		 301 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  46.58 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  52.3 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  45.55 
 
 		 326 aa  235  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  48.45 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  50.97 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  44.08 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  46.08 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  46.08 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.12 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  44.22 
 
 		 299 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  41.95 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  41.12 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  43.15 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  40.42 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  41.11 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  41.11 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  36.75 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  41.37 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  41.37 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  37.21 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  40.67 
 
 		 302 aa  198  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  36.75 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  36.88 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4510  cation diffusion facilitator family transporter  46.91 
 
 		 247 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  39.94 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 		 307 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  41.14 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  37.8 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  40.86 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  39.29 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.88 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  36.88 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  37.21 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  37.21 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.88 
 
 		 299 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  37.11 
 
 		 305 aa  188  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  41.84 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  40.58 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  39.41 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  37.36 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  45.87 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  40.5 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  40.5 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  40.5 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  41.14 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  33.68 
 
 		 306 aa  179  8e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  39.16 
 
 		 307 aa  178  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  42.71 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  42.91 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  34.49 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  38.96 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  38.3 
 
 		 305 aa  175  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 		 327 aa  175  8e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  39.62 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  38.93 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  42.41 
 
 		 319 aa  172  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  36.33 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  38.24 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  38.05 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  38.24 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 321 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  39.73 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  37.93 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  38.24 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  31.65 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  38.78 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  36.68 
 
 		 306 aa  170  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  36.75 
 
 		 301 aa  170  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  42.27 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  39.25 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  40.68 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>