More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0452 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0452  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
309 aa  591  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0402588  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  44.67 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  41.28 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  41.78 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 
312 aa  211  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  41.5 
 
 
302 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  40.93 
 
 
299 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.52 
 
 
300 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  39.52 
 
 
300 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.51 
 
 
304 aa  206  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  38.57 
 
 
326 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  37.72 
 
 
301 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  37.72 
 
 
301 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  37.72 
 
 
301 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  37.72 
 
 
301 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  42 
 
 
304 aa  202  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  40.78 
 
 
305 aa  201  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  43.86 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  38.71 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  44.28 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  41.94 
 
 
299 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  40.36 
 
 
316 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  40.36 
 
 
316 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  37.86 
 
 
305 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  38 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  35.52 
 
 
305 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  35 
 
 
299 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  43.54 
 
 
299 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  39.16 
 
 
305 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  39.16 
 
 
305 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
300 aa  185  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  34 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 
305 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  35.59 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 
308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  33.33 
 
 
299 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  42.75 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  39.32 
 
 
306 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  34 
 
 
299 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 
307 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  36.39 
 
 
298 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  38.76 
 
 
312 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
315 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  37.36 
 
 
297 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  40.79 
 
 
312 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  40.79 
 
 
312 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  40.79 
 
 
312 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  40.79 
 
 
312 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  40.79 
 
 
312 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  34.94 
 
 
299 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 
305 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  37.22 
 
 
314 aa  175  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  36.73 
 
 
298 aa  175  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  32.51 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  38.85 
 
 
340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.85 
 
 
297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.85 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.57 
 
 
299 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  34.2 
 
 
295 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  34.2 
 
 
299 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  34.2 
 
 
299 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  37.76 
 
 
317 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  40.07 
 
 
313 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  36.58 
 
 
301 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.2 
 
 
299 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  35.34 
 
 
327 aa  170  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  34.53 
 
 
309 aa  169  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  36.59 
 
 
331 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 
300 aa  166  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  40.75 
 
 
313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  40.41 
 
 
313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  40.41 
 
 
313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  37.94 
 
 
356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  40.41 
 
 
313 aa  165  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  40.41 
 
 
313 aa  165  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  40.41 
 
 
313 aa  165  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  40.41 
 
 
313 aa  165  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  37.06 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  33.55 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  32.57 
 
 
398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  33.82 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 
313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  38.83 
 
 
312 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  38.83 
 
 
312 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  34.05 
 
 
347 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  36.61 
 
 
308 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  39.42 
 
 
312 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  36.65 
 
 
327 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  34.57 
 
 
326 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 
306 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  32.04 
 
 
298 aa  156  4e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4981  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  37.08 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  41.26 
 
 
308 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  31.94 
 
 
312 aa  155  8e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 
303 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 
328 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 
325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>