More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3642 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 299 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  66.21 
 
 		 305 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  61.09 
 
 		 305 aa  358  6e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  62.99 
 
 		 305 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  62.99 
 
 		 305 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  61.77 
 
 		 313 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  52.96 
 
 		 304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  51.06 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  51.06 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  51.06 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  51.06 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  47.1 
 
 		 305 aa  275  9e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  48.97 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  46.78 
 
 		 299 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  48.41 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  47.25 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  47.08 
 
 		 326 aa  255  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  46.24 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  48.46 
 
 		 305 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  45.26 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  45.1 
 
 		 342 aa  250  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  46.6 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  44.56 
 
 		 299 aa  248  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  46.56 
 
 		 299 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  44.21 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  47.32 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  43.86 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  47.32 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  46.95 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  47.97 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  48.92 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  46.18 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  45.8 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  45.8 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  45.8 
 
 		 295 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  44.93 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  46.15 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.21 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  44.21 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  47.31 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  46.29 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  48.07 
 
 		 299 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  45.55 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  46.45 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  44.02 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  42.52 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  47.97 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  44.4 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  47.97 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  42.49 
 
 		 333 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  41.75 
 
 		 352 aa  218  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  45.8 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  38.52 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  42.71 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  43.88 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  41.81 
 
 		 304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  41.12 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 		 340 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  43.66 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  40.41 
 
 		 398 aa  209  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  43.88 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  44.98 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  45.8 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  40.47 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  38.93 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  40.62 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  44.77 
 
 		 328 aa  202  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  42.37 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  40.81 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  40.14 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  38.02 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  38.13 
 
 		 331 aa  198  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  38.49 
 
 		 312 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  42.7 
 
 		 309 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  38.69 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 		 301 aa  198  9e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  41.24 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  38.49 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  38.97 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  38.49 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  34.47 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  40.98 
 
 		 325 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  40.98 
 
 		 325 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  41.85 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  41.85 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  38.69 
 
 		 326 aa  195  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  45.05 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  42.21 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  39.58 
 
 		 313 aa  191  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  40.98 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  41.79 
 
 		 356 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  41.67 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  40.89 
 
 		 321 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  35.76 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  41.03 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  40.3 
 
 		 325 aa  188  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>