More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4059 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 305 aa  591  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  56.57 
 
 		 299 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  56.57 
 
 		 298 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  56.57 
 
 		 298 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  56.57 
 
 		 298 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0231  cation diffusion facilitator family transporter  57.58 
 
 		 307 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  55.36 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  47.19 
 
 		 302 aa  254  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  53.63 
 
 		 309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  47.12 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  46.23 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  47.57 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  44.08 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  43.24 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  46.15 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  42.81 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4981  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  48.6 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  39.39 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  42.55 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  42.55 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  40.64 
 
 		 313 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 		 305 aa  191  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  36.36 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  42.27 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  40.6 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  40.6 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  41.58 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  40.6 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  36.04 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  40.6 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  35.93 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.27 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  36.27 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  36.27 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.61 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  35.93 
 
 		 299 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  39.53 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  39.53 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.9 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  36.9 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  43.79 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  41.38 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  38.98 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  39.16 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  38.93 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09800  cation diffusion facilitator family transporter  45.63 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.492216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37.87 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  35.88 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  41.98 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  34.2 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.3 
 
 		 304 aa  169  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0452  cation diffusion facilitator family transporter  41.6 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0402588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  36.06 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  36.45 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  38.31 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  39.32 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  37.97 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  39.63 
 
 		 300 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  36.18 
 
 		 347 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  45.83 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  32.17 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  37.07 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  38.23 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  39.64 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  39.48 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  36.62 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  34.17 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  37.37 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 		 356 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  34.29 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  34.32 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  33.45 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  35.16 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.38 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  32.56 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4374  cation diffusion facilitator family transporter  36.26 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.38 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  30.91 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  30.54 
 
 		 398 aa  145  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  31.97 
 
 		 359 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  31.16 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  37.82 
 
 		 328 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  30.25 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  33.33 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  29.96 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>