More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3011 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 347 aa  693    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1837  cation diffusion facilitator family transporter  63.16 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4374  cation diffusion facilitator family transporter  61.86 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  63.14 
 
 		 321 aa  355  5.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2655  cation diffusion facilitator family transporter  66.79 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6562  cation efflux family protein  62.95 
 
 		 317 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0134377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  43.18 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  48.74 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  37.55 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  36.12 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  36.54 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  38.18 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  35.79 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  35.45 
 
 		 299 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  39.87 
 
 		 302 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  36.49 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  35.45 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.12 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.45 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  38.87 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  35.12 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  35.12 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  38.89 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  35.06 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  35.69 
 
 		 301 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 301 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 301 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 301 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  40.15 
 
 		 325 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  34.37 
 
 		 398 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  40.28 
 
 		 309 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  38.36 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  37.88 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  37.22 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  38.56 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  37.5 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  38.8 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 311 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  40.59 
 
 		 300 aa  179  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  38.27 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  39.63 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  37.22 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.84 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.93 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  31.15 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.62 
 
 		 298 aa  175  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  35.13 
 
 		 305 aa  175  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  31.96 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  34.98 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  37.37 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  35.13 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  38.11 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  34.7 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  34.43 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  39.53 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  39.53 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  34.6 
 
 		 309 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  32.24 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  32.24 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  34.16 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  38.87 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  37.88 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  39.33 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  33.45 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  33.45 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  31.71 
 
 		 333 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  31.71 
 
 		 333 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  37.36 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  37.25 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  36.61 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  34.49 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  32.35 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  33.45 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  35.34 
 
 		 373 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  35.13 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  35.13 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  33.66 
 
 		 312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  32.63 
 
 		 333 aa  165  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  32.79 
 
 		 310 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  40.3 
 
 		 607 aa  165  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  33.45 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  33.58 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  32.31 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  30.88 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  35.83 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  35.11 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>