More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6562 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6562  cation efflux family protein  100 
 
 
317 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0134377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1837  cation diffusion facilitator family transporter  65.72 
 
 
334 aa  358  9e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  62.76 
 
 
347 aa  339  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  59.48 
 
 
321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4374  cation diffusion facilitator family transporter  58.56 
 
 
347 aa  299  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2655  cation diffusion facilitator family transporter  61.4 
 
 
333 aa  292  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  48.78 
 
 
314 aa  258  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  51.06 
 
 
306 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  38.21 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  38.08 
 
 
299 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  37.42 
 
 
299 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.21 
 
 
299 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  38.21 
 
 
299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  38.21 
 
 
299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.87 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  36.75 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  38.27 
 
 
295 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  37.42 
 
 
299 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 
307 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  42.11 
 
 
306 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 
315 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
342 aa  185  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  37.16 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  44.03 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  35.74 
 
 
299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  40.64 
 
 
378 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  36.19 
 
 
332 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  34.22 
 
 
325 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  36.65 
 
 
312 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  31.71 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  39.14 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  37.55 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  39.6 
 
 
304 aa  179  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  35.19 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 
305 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  36.75 
 
 
328 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  32.85 
 
 
314 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  36.64 
 
 
305 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  36.91 
 
 
308 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  34.3 
 
 
398 aa  176  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  38.69 
 
 
307 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  34.58 
 
 
329 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.18 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  33.33 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  35.64 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  41.61 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 
314 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  34.86 
 
 
331 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  37.01 
 
 
340 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  37.8 
 
 
305 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  38.13 
 
 
318 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 
352 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  36.19 
 
 
326 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  37.05 
 
 
314 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  43.6 
 
 
303 aa  169  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  36.64 
 
 
306 aa  169  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  36.92 
 
 
366 aa  168  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 
311 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  37.64 
 
 
356 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.94 
 
 
304 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  36.08 
 
 
299 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 
339 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  39.72 
 
 
307 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  37.74 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  35.56 
 
 
334 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 
341 aa  165  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  34.08 
 
 
305 aa  165  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 
308 aa  165  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  35.03 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  34.34 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 
313 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  35.81 
 
 
316 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  35.81 
 
 
316 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  36.4 
 
 
327 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  31.89 
 
 
317 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  37.92 
 
 
342 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 
308 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  37.2 
 
 
309 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.45 
 
 
300 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
298 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  34.22 
 
 
311 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 
300 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  35.09 
 
 
333 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  38.52 
 
 
307 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  29.21 
 
 
312 aa  160  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 
335 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 
325 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 
325 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 
318 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  36.71 
 
 
299 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 
297 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>