More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0974 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 314 aa  633  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  41.88 
 
 		 309 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  46.71 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  38.87 
 
 		 325 aa  238  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  40.92 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  42.52 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  42.11 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  40.61 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  37.3 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  40.48 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  41.59 
 
 		 372 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  43.46 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  38.93 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  43.88 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 339 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 		 337 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 324 aa  215  8e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  37.8 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  40.35 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  41.22 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  39.51 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  38.81 
 
 		 336 aa  212  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  37.3 
 
 		 356 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  38.03 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  39.21 
 
 		 322 aa  205  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  39.21 
 
 		 322 aa  205  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  37.34 
 
 		 307 aa  205  9e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  36.77 
 
 		 307 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  39.52 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  37.25 
 
 		 320 aa  202  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  42.15 
 
 		 373 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  36.39 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  38.05 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  38.08 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.48 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  37.42 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  35.59 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 		 333 aa  192  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  34.32 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  37.92 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  34.97 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.96 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.32 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  35.4 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  42.08 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  36.96 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  34.2 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  36.59 
 
 		 299 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  36.59 
 
 		 299 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  35.12 
 
 		 314 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  38.2 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  38.2 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  38.22 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  38.22 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  38.22 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  38.22 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  32.78 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  35.23 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.9 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  32.9 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  34.94 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.29 
 
 		 298 aa  179  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  34.73 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  37.06 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  35.11 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  32.57 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  34.9 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  32.24 
 
 		 347 aa  172  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  36.95 
 
 		 316 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  36.95 
 
 		 316 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  35.74 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  35.86 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  34.45 
 
 		 327 aa  170  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  36.3 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 398 aa  170  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  34.07 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  31.75 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  31.72 
 
 		 320 aa  169  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  33.56 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  33.68 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  31.86 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  36.14 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  34.46 
 
 		 306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  31.36 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  29.67 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  33.78 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>