More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1852 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 311 aa  598  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  46.78 
 
 		 321 aa  249  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  46.78 
 
 		 321 aa  249  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  43.54 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  36.99 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  39.03 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  38.24 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  31.65 
 
 		 294 aa  178  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  38.36 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  30.13 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  34.57 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  34.96 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  36.75 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  30.14 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  34.94 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  32.45 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  32.12 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  35.86 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  31.79 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  37.17 
 
 		 320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  36.7 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  36.96 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  31.79 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  36.02 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.79 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  33.11 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.79 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  33 
 
 		 307 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  37.09 
 
 		 337 aa  158  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  37.09 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  30.87 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  31.79 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  31.79 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  33.76 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  32.45 
 
 		 295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  36.11 
 
 		 336 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  33.57 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  31.7 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  40.66 
 
 		 342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  32.7 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  33.78 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  34.58 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  34.72 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  33.96 
 
 		 294 aa  151  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  28.17 
 
 		 284 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  32.33 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  36.96 
 
 		 318 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  36.86 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  37.76 
 
 		 626 aa  149  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  27.82 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  32.85 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  32.85 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  32.76 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  35.74 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  37.41 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  35.83 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  38.38 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  34.31 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  38.35 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  34.44 
 
 		 327 aa  145  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  35.45 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  32.47 
 
 		 305 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 		 356 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  31.64 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  31.23 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1837  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 334 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  38.58 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  32.01 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 		 329 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  37.06 
 
 		 378 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  28.15 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  28.62 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  34.47 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  35.18 
 
 		 607 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4374  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 		 347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  34.77 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0460  cation efflux system protein CzcD  33.82 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>