More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4276 on replicon NC_009008
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  100 
 
 		 325 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  99.38 
 
 		 325 aa  628  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  50.18 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  52.98 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  51.61 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  53.48 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  51.76 
 
 		 333 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  47.33 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  49.47 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  45.42 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  49 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  47.39 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  47.39 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  47.39 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  47.39 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  47.39 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  46.48 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  46.48 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  46.48 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  49.3 
 
 		 321 aa  238  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  48.4 
 
 		 313 aa  233  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  47.55 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  41.1 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  41.1 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  40.78 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  42.54 
 
 		 298 aa  222  8e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  42.7 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  40.45 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  49.11 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  48.75 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  48.75 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  48.75 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  48.75 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  48.75 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  48.75 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  40.88 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.45 
 
 		 299 aa  212  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  41.4 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  40.13 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.45 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  40.13 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  40.45 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  42.91 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  41.75 
 
 		 342 aa  209  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.75 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  43.13 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  43.37 
 
 		 307 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  38.61 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  38.61 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  38.61 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.54 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  38.61 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 347 aa  199  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  44.16 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  38.06 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  44.15 
 
 		 626 aa  195  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  42.24 
 
 		 313 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  38.63 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  41.85 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  40.89 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  45.87 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 		 398 aa  186  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  38.67 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  41.04 
 
 		 607 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  43.3 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  37.67 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  38.05 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  40.68 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  36.51 
 
 		 325 aa  178  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0726  cation efflux protein  44.63 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.951048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  36.23 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  41.98 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  43.22 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  43.22 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  39.56 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.78 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 306 aa  172  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  44.87 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4374  cation diffusion facilitator family transporter  39.38 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  39.32 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  39.32 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.44 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  35.59 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1837  cation diffusion facilitator family transporter  36.13 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4043  cation diffusion facilitator family transporter  36.07 
 
 		 328 aa  169  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3767  cation diffusion facilitator family transporter  36.07 
 
 		 328 aa  169  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.784386  normal  0.408109 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  36.96 
 
 		 311 aa  168  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0032  cation efflux family protein  33.9 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  41.73 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  34.58 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  37.31 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  36.52 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>