More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6519 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
328 aa  634    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  44.41 
 
 
299 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  44.41 
 
 
299 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  44.1 
 
 
299 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  43.36 
 
 
299 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.76 
 
 
299 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  44.76 
 
 
299 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.41 
 
 
299 aa  239  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  44.06 
 
 
299 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  44.06 
 
 
299 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  43.62 
 
 
295 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  42.72 
 
 
398 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  45.6 
 
 
342 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  39.94 
 
 
325 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  43.66 
 
 
315 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 
321 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  42.18 
 
 
327 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  52.76 
 
 
299 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  43.86 
 
 
314 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  40.29 
 
 
342 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  49.66 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  41.41 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  43.59 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  42.91 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  48.31 
 
 
342 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  43.96 
 
 
299 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  46.95 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  42.91 
 
 
305 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  43.62 
 
 
298 aa  212  9e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  41.91 
 
 
305 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  39.57 
 
 
315 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  41.91 
 
 
305 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  42.23 
 
 
352 aa  208  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  41.88 
 
 
312 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  41.88 
 
 
312 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  41.88 
 
 
312 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  41.96 
 
 
326 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  42.49 
 
 
333 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  45.79 
 
 
325 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  45.79 
 
 
325 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  41.28 
 
 
340 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  43.16 
 
 
299 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  39.68 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  42.36 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 
308 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  36.7 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  42.8 
 
 
378 aa  199  6e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  38.81 
 
 
306 aa  199  7e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  41.95 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  45.14 
 
 
300 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  43.21 
 
 
316 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  43.21 
 
 
316 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
305 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  39.44 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  40.28 
 
 
302 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  39.66 
 
 
347 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.52 
 
 
304 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  44.41 
 
 
356 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  42.8 
 
 
309 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  41.75 
 
 
300 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
317 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.75 
 
 
300 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  39.79 
 
 
306 aa  192  6e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  42.91 
 
 
312 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  43.86 
 
 
310 aa  192  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  36.11 
 
 
298 aa  191  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  38.69 
 
 
298 aa  190  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  38.83 
 
 
311 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  43.3 
 
 
312 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  41.77 
 
 
339 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  37.85 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  43.3 
 
 
312 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  43.3 
 
 
312 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  43.3 
 
 
312 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  40.15 
 
 
337 aa  188  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  42.96 
 
 
312 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  37.5 
 
 
334 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  41.41 
 
 
303 aa  188  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 
339 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  38.68 
 
 
325 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  38.68 
 
 
325 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  38.21 
 
 
298 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  42.31 
 
 
299 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  43.16 
 
 
321 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  37.77 
 
 
331 aa  186  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  37.2 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  42.35 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  41.1 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  40.2 
 
 
309 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  41.81 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  37.79 
 
 
305 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  42.05 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  36.01 
 
 
323 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>