More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1490 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 337 aa  664    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  97.35 
 
 		 339 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  83.33 
 
 		 325 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  72.63 
 
 		 314 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  67.49 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  68.67 
 
 		 329 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  65.84 
 
 		 329 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  65.06 
 
 		 372 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  69.93 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  67.13 
 
 		 318 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  61.07 
 
 		 320 aa  345  5e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  68.07 
 
 		 314 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  59.07 
 
 		 300 aa  333  4e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  64.69 
 
 		 318 aa  325  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  65.72 
 
 		 313 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  61.11 
 
 		 336 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  56.25 
 
 		 333 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  56.25 
 
 		 333 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  59.12 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  59.86 
 
 		 328 aa  302  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  56.49 
 
 		 324 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  60.66 
 
 		 322 aa  298  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  60.66 
 
 		 322 aa  298  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  56.29 
 
 		 329 aa  297  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  54.51 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  56.12 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  53.38 
 
 		 306 aa  288  9e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  48.59 
 
 		 373 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  53.85 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  58.42 
 
 		 346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  51.38 
 
 		 297 aa  278  9e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  48.17 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  54.74 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  53.15 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  53.12 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  50.98 
 
 		 302 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  51.1 
 
 		 335 aa  248  8e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  46.71 
 
 		 309 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  43.27 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  43.93 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  42.41 
 
 		 305 aa  219  7e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  38.57 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  42.45 
 
 		 303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  39.71 
 
 		 296 aa  206  7e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  36.01 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  37.09 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  36.09 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  36.09 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  40.15 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  35.1 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  35.1 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.77 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  38.49 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.1 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  41.72 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  35.1 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  36.98 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 307 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  36.92 
 
 		 311 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  40.15 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  38.27 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  36.39 
 
 		 312 aa  178  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  35.93 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  35.92 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  38.21 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  40.39 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  34.52 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  35.49 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  36.11 
 
 		 305 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.1 
 
 		 304 aa  169  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  36.76 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  38.53 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  36.7 
 
 		 299 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 		 327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1837  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  34.98 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  37.64 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  36.3 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  36.04 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  37.72 
 
 		 300 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  36.04 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  36.04 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  36.04 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  36.16 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  36.16 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.27 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>