More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0606 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 356 aa  703    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  57.58 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  59.46 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  59.12 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  54.63 
 
 		 333 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  54.63 
 
 		 333 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  54.66 
 
 		 329 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  54.05 
 
 		 332 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  55.76 
 
 		 329 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  55.93 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  49.67 
 
 		 300 aa  281  9e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  58.95 
 
 		 314 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  54.55 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  53.85 
 
 		 318 aa  275  7e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  51.6 
 
 		 372 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  53.49 
 
 		 318 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  54.64 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  54.64 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  52.49 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  48.88 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  50.33 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  49.86 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  47.63 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  54.32 
 
 		 328 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  51.19 
 
 		 366 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  51.67 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  55.59 
 
 		 333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  46.03 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  54.23 
 
 		 336 aa  255  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  51.06 
 
 		 329 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 309 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  47.8 
 
 		 319 aa  247  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  46.91 
 
 		 309 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  49.66 
 
 		 335 aa  242  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  53.4 
 
 		 313 aa  237  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  48.83 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  41.91 
 
 		 307 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  47.12 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  41.91 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  43.21 
 
 		 303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  39.59 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  38.03 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  40.14 
 
 		 296 aa  206  7e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  40.49 
 
 		 311 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  34.47 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  38.83 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  34.01 
 
 		 299 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  35.32 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  34.69 
 
 		 299 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  34.69 
 
 		 299 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  35.32 
 
 		 295 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 299 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.94 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.57 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  36.47 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  33.13 
 
 		 327 aa  175  9e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  35.34 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  36.47 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  37.21 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  37.42 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  37.61 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.82 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  39.49 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  37.5 
 
 		 312 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  36.64 
 
 		 299 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  39.49 
 
 		 312 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  39.49 
 
 		 312 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  36.1 
 
 		 339 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 309 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  36.49 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  39.41 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  39.41 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  39.41 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  39.41 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  39.41 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  32.92 
 
 		 317 aa  167  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  28.76 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  35.99 
 
 		 314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  35.13 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  37.07 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  35.37 
 
 		 300 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.37 
 
 		 300 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  39.18 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  33.8 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  36.75 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  36.36 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  36.99 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  35.21 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  34.26 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  35.34 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  39.14 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  32.11 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>