More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3644 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 302 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  72 
 
 		 306 aa  421  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  71.09 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  59.86 
 
 		 316 aa  317  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  52.72 
 
 		 297 aa  305  9.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  52.88 
 
 		 300 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  54.76 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  55.56 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  55.24 
 
 		 332 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  57.04 
 
 		 314 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  52.85 
 
 		 372 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  52.94 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  57.35 
 
 		 318 aa  281  8.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  53.66 
 
 		 309 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  53.87 
 
 		 325 aa  279  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  56.49 
 
 		 329 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  56.12 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  50.69 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  50.69 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  55.82 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  57.04 
 
 		 346 aa  269  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  52.3 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  52.3 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  53.61 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  50.9 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  50.91 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  53.76 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  53.41 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  51.65 
 
 		 356 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  55.96 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  48.81 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  45.21 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  44.88 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  50.53 
 
 		 373 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  52.74 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  50.17 
 
 		 306 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  49.82 
 
 		 324 aa  242  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  46.49 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  48.55 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  40.7 
 
 		 303 aa  222  7e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  39.43 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  36.9 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  36.86 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  37.85 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  35.57 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.43 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  34.26 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  34.26 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  37.11 
 
 		 299 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  39.15 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.81 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  36.81 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  33.56 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  34.93 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.22 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  36.08 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  34.9 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.22 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  33.08 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  34.22 
 
 		 295 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  33.1 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  33.1 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  37.8 
 
 		 307 aa  159  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  33.21 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  32.85 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  37.5 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  35.45 
 
 		 311 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  33.55 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  33.57 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  32.4 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  34.3 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  34.58 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  34.58 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  31.45 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  35.2 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  38.24 
 
 		 342 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  35.2 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  35.2 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  32.09 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  35.2 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 321 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  34.87 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 626 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  31.49 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>