More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3672 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 329 aa  649    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  66 
 
 		 320 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  58.09 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  55.36 
 
 		 372 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  60.69 
 
 		 329 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  53.18 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  57.79 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  54.18 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  53.18 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  59.86 
 
 		 314 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  52.55 
 
 		 325 aa  322  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  55.9 
 
 		 322 aa  311  9e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  55.9 
 
 		 322 aa  311  9e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  56.99 
 
 		 339 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  55.14 
 
 		 318 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  55.25 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  56.29 
 
 		 337 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  55.59 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  51 
 
 		 300 aa  297  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  56.48 
 
 		 313 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  55.67 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  53.62 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  51.17 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  51.77 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  47.49 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  52.86 
 
 		 346 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  51.1 
 
 		 373 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  51.92 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  49.13 
 
 		 366 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  51.42 
 
 		 356 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  45.32 
 
 		 356 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  50.34 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  48.62 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  48.78 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  45.48 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  44.26 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  43.24 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  44.78 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  41.22 
 
 		 314 aa  212  7e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  40.07 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  40.55 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  41.1 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  38.77 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  37.98 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  36.24 
 
 		 312 aa  192  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  35.69 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  38.05 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.47 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  38.74 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  34.49 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  35.67 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  33.91 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  37.4 
 
 		 315 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  34.47 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  34.47 
 
 		 299 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  34.12 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  36.62 
 
 		 314 aa  176  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  33.79 
 
 		 299 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  34.72 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  33.79 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  36.06 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.93 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 		 311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  36.15 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  36.15 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  37.37 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  35.77 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.45 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  34.49 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  35.47 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.78 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 298 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  38.24 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  37.19 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  35 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 		 342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  35.99 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  35.99 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  35.64 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  35.38 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  35.64 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  35.64 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  37.4 
 
 		 315 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 297 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  36.55 
 
 		 314 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  35.47 
 
 		 334 aa  162  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  35.38 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>