More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4537 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 309 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  52.58 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  48.32 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  45.07 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  41.92 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  51.07 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  45.97 
 
 		 306 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  47.46 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  45.93 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  45.93 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  47 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  48.94 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  49.16 
 
 		 319 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  45.51 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  47.9 
 
 		 336 aa  238  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  47 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  48.91 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  48.01 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  48.01 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  44.01 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  47.02 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  48 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  44.91 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  51.26 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  46.49 
 
 		 302 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  46.98 
 
 		 335 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  46.43 
 
 		 366 aa  225  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  50.18 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  48.4 
 
 		 373 aa  221  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  48.75 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  47.65 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  46.43 
 
 		 356 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  47.29 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  43.19 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  44.66 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  42.86 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  48.24 
 
 		 313 aa  212  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  45.16 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  36.93 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  37.82 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  34.08 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  38.49 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  37.37 
 
 		 342 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  33.01 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  33.12 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  33.65 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  35.52 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 317 aa  182  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  36.11 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  34.18 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.82 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  34.18 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  34.18 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.18 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  36.61 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  36.61 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.61 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.61 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.84 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  33.82 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  39.08 
 
 		 315 aa  175  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  35.48 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  35.48 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  35.48 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37.96 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  36.47 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  32.26 
 
 		 326 aa  172  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  33.7 
 
 		 334 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  32.42 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  36.13 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  32.42 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  35 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  36.45 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  32.62 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  34.43 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  34.55 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  37.06 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  37.95 
 
 		 365 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  34.3 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  32.99 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  34.07 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  35 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  34.43 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  30.96 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  35.45 
 
 		 299 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3767  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.784386  normal  0.408109 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4043  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>