More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1700 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  100 
 
 		 303 aa  605  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  51.96 
 
 		 309 aa  318  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  45.15 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  46.71 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  44.52 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  42.66 
 
 		 300 aa  242  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  41.25 
 
 		 297 aa  238  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  40.94 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  43.62 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  43.62 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  42.18 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  42.25 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  45.85 
 
 		 314 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  39.25 
 
 		 332 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  40.74 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  42.46 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  38.85 
 
 		 320 aa  228  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  43.1 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  43.21 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  41.91 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  42.05 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  45.13 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  43.97 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  41.99 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  41.99 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  40.56 
 
 		 314 aa  221  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  42.45 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  42.45 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  41.72 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 		 346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  37.87 
 
 		 366 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  41.45 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  38.41 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  40.28 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  40.29 
 
 		 329 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  42.4 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  36.2 
 
 		 317 aa  199  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  37.11 
 
 		 305 aa  192  4e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  38.71 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  35.12 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  33.56 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  40.43 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  32.89 
 
 		 299 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  32.89 
 
 		 299 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  34.83 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  34.41 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.83 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.83 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  34.83 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  34.84 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  34.81 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  37.17 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  34.73 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  36.23 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  32.99 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  35.33 
 
 		 398 aa  172  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.66 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 		 343 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  36.12 
 
 		 327 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  31.52 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  30.46 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  34.13 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  34.56 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  34.21 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.72 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  31.58 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  29.9 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  34.46 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 		 365 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  33.92 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  33.92 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  34.44 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  34.53 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  30.91 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  33.92 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  29.96 
 
 		 331 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  36.19 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  34.6 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  30.63 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>