More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4665 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 336 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  58.01 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  62.37 
 
 		 329 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  60.14 
 
 		 320 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  61.11 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  60.42 
 
 		 314 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  60.76 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  59.44 
 
 		 332 aa  311  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  53.44 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  53.44 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  61.81 
 
 		 329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  63.41 
 
 		 372 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  60.62 
 
 		 314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  61.48 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  53.33 
 
 		 300 aa  296  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  54.95 
 
 		 297 aa  296  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  59.64 
 
 		 322 aa  295  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  59.64 
 
 		 322 aa  295  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  61.01 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  55.59 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  56.16 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  62.41 
 
 		 313 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  58.01 
 
 		 346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  55.4 
 
 		 306 aa  279  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  53.42 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  54.74 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  52.71 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  56.19 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  54.58 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  54.98 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  54.04 
 
 		 356 aa  264  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  53.64 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  52.9 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  47.49 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  53.74 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  46.8 
 
 		 307 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  47.21 
 
 		 309 aa  248  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  54.12 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  50.88 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  42.46 
 
 		 303 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  38.81 
 
 		 314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  41.9 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  37.37 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 		 326 aa  190  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  38.65 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  36.01 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  34.8 
 
 		 299 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  36.21 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  36.21 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.21 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.21 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  34.82 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  32.3 
 
 		 294 aa  179  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  37.46 
 
 		 314 aa  179  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  35.45 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 		 316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  33.82 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37.15 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  35.99 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.04 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  29.15 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  32.57 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  34.56 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  31.16 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  31.99 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  37.06 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  34.38 
 
 		 331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  33.78 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  32.24 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  31.91 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  34.21 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  31.58 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  32.4 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  34.73 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  34.38 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  35.4 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  34.38 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  38.81 
 
 		 299 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  34.07 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  34.38 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  34.38 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  34.46 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  30.93 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  31.91 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  31.54 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  31.54 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  29.45 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  33.54 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>