More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3964 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 321 aa  651    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 321 aa  651    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  71.67 
 
 		 302 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  46.78 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  46.85 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  41.49 
 
 		 311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  37.42 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  35.43 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  34.71 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  32.03 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  32.03 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  34.03 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  37.23 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  35.85 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  35.37 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  35.95 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  36.71 
 
 		 317 aa  169  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  32.62 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  32.32 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  35.89 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  32.87 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  32.87 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  32.87 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  32.87 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  34.63 
 
 		 311 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  34.38 
 
 		 329 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  32.89 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  32.89 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  34.16 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  33.01 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.56 
 
 		 304 aa  159  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  30.41 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  32.23 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.82 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  31.86 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  28.8 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  32.87 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  31.38 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  33.45 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  32.77 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  32.87 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  33.45 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  32.65 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  31.93 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  31.51 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  34.17 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  32.2 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 		 329 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 336 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 		 335 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  35.54 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  32.58 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  32.77 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  32.66 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  31.92 
 
 		 313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0032  cation efflux family protein  30.23 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  29.52 
 
 		 312 aa  146  6e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  31.25 
 
 		 313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  32.66 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  32.66 
 
 		 342 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  29.53 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  32.32 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  31.54 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.46 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  30 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0153  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0646969  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  30.46 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  33.09 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  30.87 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  32.27 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  35.55 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  29.31 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  29.31 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.99 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 		 305 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 		 305 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  29.53 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  30.51 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  30.51 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  32.98 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  30.5 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.99 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  30.5 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0020  cation efflux family protein  29.24 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>